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    群體結構——PCA分析

    概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析则酝。主成分分析也稱主分量分析,旨在利用降維的思想,把多指標轉化為少數幾個綜合指標。 在統(tǒng)計...

  • 文章寫的很好,很詳細,但是重新添加SNP編號那行代碼是不是有點問題

    admixture 群體結構分析

    tructure是與PCA、進化樹相似的方法装蓬,就是利用分子標記的基因型信息對一組樣本進行分類,分子標記可以是SNP纱扭、indel牍帚、SSR。相比于PCA跪但,進化樹履羞,群體結構分析可明...

  • 構建 IBS 矩陣后,怎樣得到IBS 距離矩陣屡久?

    群體遺傳學之個體間遺傳距離及其計算方法

    01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...

  • 是不是直接用第三步就可以忆首,不用第二步轉換一下

    利用EIGENSOFT中的smartpca模塊進行PCA分析

    這個工具是很經典老牌的工具,是非潮换罚可靠也得到了學術界認可的一款軟件糙及。工具官網:https://www.hsph.harvard.edu/alkes-price/softwar...

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    跑通GWAS,用這些腳本就夠了

    最近跑通了一遍GWAS分析聪蘸,全程在linux操作宪肖,雖然具體還有好多需要微調的地方,先把代碼整理分享出來mark一下 前期準備 1.理論知識 強烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...

  • 很通俗易懂??不過你表格上面小爹小媽的基因型好像寫反了

    binmap-123

    原網址:1)http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2)http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...

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