概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想蒂秘，把多指標轉化為少數(shù)幾個綜合指標魔策。 在統(tǒng)計...
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群體結構——PCA分析 -
文章寫的很好碎税，很詳細润努，但是重新添加SNP編號那行代碼是不是有點問題
admixture 群體結構分析
tructure是與PCA情连、進化樹相似的方法貌矿，就是利用分子標記的基因型信息對一組樣本進行分類炭菌，分子標記可以是SNP、indel逛漫、SSR黑低。相比于PCA，進化樹酌毡，群體結構分析可明...
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構建 IBS 矩陣后克握，怎樣得到IBS 距離矩陣？
群體遺傳學之個體間遺傳距離及其計算方法
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
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是不是直接用第三步就可以枷踏，不用第二步轉換一下
利用EIGENSOFT中的smartpca模塊進行PCA分析
這個工具是很經(jīng)典老牌的工具菩暗，是非常可靠也得到了學術界認可的一款軟件呕寝。工具官網(wǎng)：https://www.hsph.harvard.edu/alkes-price/softwar...
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跑通GWAS，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析岗屏，全程在linux操作辆琅，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準備 1.理論知識 強烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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很通俗易懂??不過你表格上面小爹小媽的基因型好像寫反了
binmap-123
原網(wǎng)址：1）http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2）http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...
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關注：生物統(tǒng)計，數(shù)量遺傳，混合線性模型昙衅，生物信息扬霜，R，Perl而涉，Python著瓶，GWAS，GS相關方法啼县，文章及代碼<br>
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