概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析冕屯。主成分分析也稱主分量分析钾怔，旨在利用降維的思想衅檀，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)菇曲。 在統(tǒng)計(jì)...
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群體結(jié)構(gòu)——PCA分析 -
文章寫的很好神僵，很詳細(xì)熊经，但是重新添加SNP編號(hào)那行代碼是不是有點(diǎn)問題
admixture 群體結(jié)構(gòu)分析
tructure是與PCA、進(jìn)化樹相似的方法猖毫，就是利用分子標(biāo)記的基因型信息對(duì)一組樣本進(jìn)行分類镣煮，分子標(biāo)記可以是SNP、indel鄙麦、SSR。相比于PCA镊折，進(jìn)化樹胯府，群體結(jié)構(gòu)分析可明...
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構(gòu)建 IBS 矩陣后，怎樣得到IBS 距離矩陣恨胚？
群體遺傳學(xué)之個(gè)體間遺傳距離及其計(jì)算方法
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
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是不是直接用第三步就可以骂因，不用第二步轉(zhuǎn)換一下
利用EIGENSOFT中的smartpca模塊進(jìn)行PCA分析
這個(gè)工具是很經(jīng)典老牌的工具，是非吃吲荩可靠也得到了學(xué)術(shù)界認(rèn)可的一款軟件寒波。工具官網(wǎng)：https://www.hsph.harvard.edu/alkes-price/softwar...
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跑通GWAS蓖柔，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析辰企，全程在linux操作，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方况鸣，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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很通俗易懂??不過你表格上面小爹小媽的基因型好像寫反了
binmap-123
原網(wǎng)址：1）http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2）http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生镐捧。
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關(guān)注：生物統(tǒng)計(jì)，數(shù)量遺傳帮辟，混合線性模型速址，生物信息，R由驹，Perl芍锚，Python，GWAS蔓榄，GS相關(guān)方法并炮，文章及代碼<br>
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搬磚的工人<br>
