發(fā)簡信
IP屬地：浙江
-
曼哈頓圖--R可視化曼哈頓圖(Manhattan plot)是一種GWAS分析中常用的展示基因組數(shù)據(jù)的散點圖〉牵可以R語言中的qqman躲惰、CMplot及ggplot2...
-
格式轉(zhuǎn)換--2024-03-23
格式轉(zhuǎn)換hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二進(jìn)制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap...
-
vcf 2 hammp 2024-03-18
第一步致份，利用GATK中 VariantsToTable 將vcf文件格式轉(zhuǎn)化 第二步：使用如下R腳本將變量表轉(zhuǎn)換為hapmap。 注意：僅僅在單...
-
GWAS 分析 2024-03-17
概念 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”础拨，使用統(tǒng)計模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點氮块，用于分子標(biāo)記選擇（MAS）或者基因定位。 （2）GWAS分析...
-
vcftools使用2024-03-17
vcftools主要處理vcf/bcf文件诡宗，包括：過濾(filter) 滔蝉；變異位點的基本統(tǒng)計；數(shù)據(jù)格式的轉(zhuǎn)換塔沃；多個vcf文件的比較（compar...