瓜農(nóng)小程

@假如我重生了 就是tassel軟件包腳本

格式轉(zhuǎn)換--2024-03-23

格式轉(zhuǎn)換hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二進制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap <-> vcf hapm...

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格式轉(zhuǎn)換hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二進制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap <-> vcf hapm...

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前面介紹了 QTL 分析的一般流程：包括數(shù)據(jù)輸入，數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查嚼酝，單 QTL 分析。對這個過程已經(jīng)比較了解了竟坛。 R/qtl 定位分析（一）讀取數(shù)據(jù)[https://www.ji...

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第一步闽巩，利用GATK中 VariantsToTable 將vcf文件格式轉(zhuǎn)化 第二步：使用如下R腳本將變量表轉(zhuǎn)換為hapmap。 注意：僅僅在單倍體担汤，雙等位基因型SNP中得到...

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概念 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”涎跨，使用統(tǒng)計模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點，用于分子標(biāo)記選擇（MAS）或者基因定位漫试。 （2）GWAS分析的兩類性狀： 分類性狀（閾值性...

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vcftools主要處理vcf/bcf文件六敬，包括：過濾(filter) ；變異位點的基本統(tǒng)計驾荣；數(shù)據(jù)格式的轉(zhuǎn)換外构；多個vcf文件的比較（compare files）普泡；集合運算等。...