IP屬地：遼寧
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2022新版TCGA數(shù)據(jù)下載與整理2022年4月份TCGA進(jìn)行了更新，測(cè)序數(shù)據(jù)變成了STAR-count文件。以往count文件是htseq.counts.gz格式，現(xiàn)在變成star_gene_counts....
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Kraken使用手冊(cè)
Introduction Kraken 是可將分類(lèi)標(biāo)簽分配給DNA序列的一種序列分類(lèi)器印叁，是基于k-mer精確比對(duì)，并采用最低公共祖先(lowest common ancest...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過(guò)conda安裝姆打，省去了很多的安裝、修bug的煩惱肠虽。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件幔戏，conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問(wèn)我gatk 3.8的版本在哪里...
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conda的安裝與使用（2021-04-27更新）存檔版
2021-04-27 update: 更新了提供conda鏡像的大學(xué)的列表2021-04-13 更新預(yù)告: 本來(lái)打算在閱讀量過(guò)40萬(wàn)的時(shí)候更新一遍新的內(nèi)容的. 但是時(shí)間精力實(shí)...
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PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
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conda的安裝與使用（2021-04-27更新）
轉(zhuǎn)自：賣(mài)萌哥[http://www.reibang.com/u/77fc519c6fa2] 2021-04-27 update: 更新了提供conda鏡像的大學(xué)的列表 20...
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生物信息；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號(hào)～
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本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)彪蓬，浙大讀博ing寸莫。<br>如果沒(méi)有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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不做無(wú)條件咨詢(xún)膘茎，見(jiàn)諒
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決定用四年的時(shí)間記錄自己的成長(zhǎng)披坏；<br>女孩子也可以努力的很漂亮；<br>喜歡的東西都很貴呛牲，所以要加油呀刮萌。<br>VX公共號(hào)：學(xué)生菌口替代表
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組間差異檢驗(yàn)驮配，終于有人講清楚了!什么是組間差異檢驗(yàn)娘扩？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗(yàn)，應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)上的假設(shè)檢驗(yàn)方法壮锻，檢驗(yàn)組間是否有差異及其差異程度琐旁。坦率地講，所有的差異檢驗(yàn)都基于一個(gè)假設(shè)：組間沒(méi)有差異猜绣，變量之...
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16S測(cè)序分析（四）用MaAsLin尋找組間差異細(xì)菌導(dǎo)讀 MaAsLin（Multivariate Analysis by Linear Models灰殴，多變量線(xiàn)性回歸模型）功能：相關(guān)性分析特點(diǎn)：多表型同時(shí)分析，矯正協(xié)變量數(shù)據(jù)輸...
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16S測(cè)序分析（三）用LEfSe尋找組間差異細(xì)菌導(dǎo)讀 前面已經(jīng)介紹了獲取菌屬相對(duì)豐度表的方法掰邢，以及多樣性分析中的基本概念和計(jì)算方法牺陶。接下來(lái)將開(kāi)始介紹一種尋找組間差異細(xì)菌的常用方法LEfSe伟阔。LEfSe（Linear dis...
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周運(yùn)來(lái)皱炉，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥狮鸭，穩(wěn)健合搅，瀟灑，大方歧蕉，靠譜灾部。一段生信緣，一棵技能樹(shù)惯退。生信技能樹(shù)核心成員赌髓，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者催跪，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家春弥。
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8年高通量測(cè)序行業(yè)一份子/技術(shù)總監(jiān)<br>任職于：上海慕柏生物醫(yī)學(xué)科技有限公司<br>主攻方向：微生物生態(tài)學(xué)<br>郵箱聯(lián)系： jiaruisun@mobiomed.com
