如是我聞
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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2021-08-13 bed文件轉(zhuǎn)換成gtf文件convert bed to gtf 1.使用conda安裝bedtogenepred和genepredtogtf包 conda install -c bioconda uc...
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歡迎關(guān)注公眾號(hào) “生信交流平臺(tái)”
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『鵝廠號(hào): 生信云筆記』分享生信分析及數(shù)據(jù)可視化相關(guān)的內(nèi)容祷蝌，歡迎關(guān)注和交流！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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Python學(xué)習(xí)筆記02
判斷語(yǔ)句 if 語(yǔ)句: 單分支 語(yǔ)法:if 條件判斷: 輸出的內(nèi)容 if - else 語(yǔ)句: 雙分支 語(yǔ)法:if 條件判斷: 輸出的內(nèi)容else: 輸出的...
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Trimmomatic數(shù)據(jù)質(zhì)控
生信分析中最常見的數(shù)據(jù)格式應(yīng)該就是fastq了。我們最初拿到的數(shù)據(jù)也是fastq格式钾埂。通常情況下，原始下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)過拆分之后獲得的數(shù)據(jù)中會(huì)包含有低質(zhì)量姜性、N(未知堿基)部念、接頭序列...
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生物信息學(xué)博士聂沙、主要從事腫瘤基因組相關(guān)研究，歡迎打擾
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根據(jù)GTF文件，提取基因組中Exon房铭、Intron温眉、Intergenetic等不同區(qū)域
目標(biāo)： 根據(jù)下載的GTF文件，利用bedtools提取基因組的不同區(qū)域凌蔬。 實(shí)例： 見參考的網(wǎng)站 參考： 1闯冷、https://davetang.org/muse/2013/01...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測(cè)序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程這篇文章很長(zhǎng)，超過1萬(wàn)字砾淌，是本系列中最重要的一篇谭网，因?yàn)槲也⒎侵皇窃诤?jiǎn)單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對(duì)于新手而言不建議碎片時(shí)間閱讀劫乱，對(duì)于有一定經(jīng)驗(yàn)的老手來說织中，相信依然可以有...
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不斷學(xué)習(xí)，不斷忘記叉橱，不斷回顧者蠕，不斷進(jìn)步，這便是凡人的學(xué)習(xí)方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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生信地基系列--bedtools
雖然有人寫的挺好的了最全Bedtools使用說明--只看本文就夠了 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/f8bbd51b...
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請(qǐng)問怎么把DMR注釋到TE上呀
R語(yǔ)言 -- 尋找差異甲基化區(qū)域（DMR）-- DSS 包
最好的文檔其實(shí)還是官方文檔逞壁。。腌闯。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...
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菜雞
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轉(zhuǎn)座子（TE,散在重復(fù)）特征及其對(duì)基因組影響基因組中重復(fù)序列大體分為兩類：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats趁冈，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測(cè)）散在重復(fù)（Dispersed repeats），...
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R語(yǔ)言 -- 尋找差異甲基化區(qū)域（DMR）-- DSS 包
最好的文檔其實(shí)還是官方文檔旺坠。扮超。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...
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分享生信知識(shí)。全網(wǎng)同名矢炼，有問題搜索工種昊留言??
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一只努力向上爬的蝸牛。<br>研究方向：基因組&??<br>交流郵箱：1109868133@qq.com
