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convert bed to gtf 1.使用conda安裝bedtogenepred和genepredtogtf包 conda install -c bioconda uc...
判斷語句 if 語句: 單分支 語法:if 條件判斷: 輸出的內(nèi)容 if - else 語句: 雙分支 語法:if 條件判斷: 輸出的內(nèi)容else: 輸出的...
生信分析中最常見的數(shù)據(jù)格式應該就是fastq了荡澎。我們最初拿到的數(shù)據(jù)也是fastq格式均践。通常情況下,原始下機數(shù)據(jù)經(jīng)過拆分之后獲得的數(shù)據(jù)中會包含有低質量衔瓮、N(未知堿基)浊猾、接頭序列...
目標: 根據(jù)下載的GTF文件澄港,利用bedtools提取基因組的不同區(qū)域椒涯。 實例: 見參考的網(wǎng)站 參考: 1、https://davetang.org/muse/2013/01...
這篇文章很長,超過1萬字狱意,是本系列中最重要的一篇湖苞,因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀详囤,對于有一定經(jīng)驗的老手來說财骨,相信依然可以有...
雖然有人寫的挺好的了最全Bedtools使用說明--只看本文就夠了 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/f8bbd51b...
請問怎么把DMR注釋到TE上呀
R語言 -- 尋找差異甲基化區(qū)域(DMR)-- DSS 包最好的文檔其實還是官方文檔娃属。六荒。。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...
基因組中重復序列大體分為兩類:串聯(lián)重復(Tandem repeats,Tandem Duplication) (TRF可預測)散在重復(Dispersed repeats)秩铆,...
最好的文檔其實還是官方文檔砚亭。。殴玛。http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DSS/inst/doc/DS...