問(wèn)題 在安裝包時(shí)warning顯示該包基于R 4.3.2建立沾谓,warning太多看著煩于是想要進(jìn)行更新看網(wǎng)上教程可用installr包的updateR函數(shù) 直接打開(kāi)R(不是R...
寫在前面破喻,其實(shí)現(xiàn)在網(wǎng)上很多對(duì)于一個(gè)包(一個(gè)/種分析)更多是講分析代碼或流程职祷,但是對(duì)于分析結(jié)果可視化的教程講的比較少,這導(dǎo)致我這種畫(huà)圖小白無(wú)法對(duì)結(jié)果進(jìn)行plot蚁鳖,或者可視化不如...
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激: 在細(xì)胞當(dāng)中徙垫,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)負(fù)責(zé)將多肽鏈正確折疊和加工成有功能的蛋白質(zhì)。一些外源性或內(nèi)源性因素導(dǎo)致ER內(nèi)錯(cuò)誤折疊或未折疊蛋白質(zhì)累積放棒,ER的這種應(yīng)激狀態(tài)稱為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)...
測(cè)序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline:從raw r...
今天用select函數(shù)出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)剧辐,一開(kāi)始沒(méi)注意報(bào)錯(cuò)信息寒亥,因?yàn)槲疫x擇的列名有些復(fù)雜,怕是哪里掉了個(gè)空格荧关,就重新?lián)Q了個(gè)方法選列名溉奕,還是出錯(cuò)。報(bào)錯(cuò)信息如下 簡(jiǎn)單說(shuō)忍啤,就是不知道為a這個(gè)...
第一章 使用ggplot2進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化 練習(xí) (1)運(yùn)行g(shù)gplot(data = mpg)加勤,你會(huì)看到什么? (2)數(shù)據(jù)集mpg中有多少行同波?有多少列 (4)使用hwy和cy...
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R語(yǔ)言基礎(chǔ)之第二部分:操縱數(shù)據(jù)取子集 2.1 構(gòu)建子集[ ]:提取一個(gè)or多個(gè)類型相同的元素[[ ]]:從列表或數(shù)據(jù)框中提取元素$ :按名字從列表or數(shù)據(jù)框中提取元素 2.1...
通常大家使用下面的代碼下載任意GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)集: 通常只有的網(wǎng)絡(luò)錯(cuò)誤冤狡,都很詭異孙蒙,畢竟長(zhǎng)城在這里。 解決方式也簡(jiǎn)單悲雳,加上代碼: options( 'download.fil...
TCGA數(shù)據(jù)下載方法:gdc-client挎峦,Xena和gdcRNAtools 需要下載的數(shù)據(jù)組學(xué)信息(樣本):(存儲(chǔ)單個(gè)病人表達(dá)數(shù)據(jù),需整理為表達(dá)矩陣) + (存儲(chǔ)樣本文件的...