生信小白<br>
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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@鐵線蓮 你好，請問stairway plot中的參數(shù)L是如何計算的呢至非，我一直沒弄明白
種群動態(tài)歷史評估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）
SFS的基本理解钠署、介紹的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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「群體遺傳學(xué)實戰(zhàn)」第一課: 對SNP位點進(jìn)行注釋我們用于實戰(zhàn)的數(shù)據(jù)集來自于2019年發(fā)表于NG的西瓜文章揪垄，它提供了GATK過濾后的SNP數(shù)據(jù)集用于分析，并且附錄提供了完整的樣本信息逻翁。該SNP數(shù)據(jù)集包括414個西瓜饥努，2000...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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你好滴铅，老師！最近在研究你這個腳本的用法汉匙，可以我總是一運行就出現(xiàn)問題拱烁。
The drictory is: D:\worksoftware\callCodeml-main\paml
The treeFile is: D:\worksoftware\callCodeml-main\31.nwk
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2021-08-11 00:26:27 Staring ModelA null of accD_mafft ...
0%| | 0/78 [00:00<?, ?it/s]
Traceback (most recent call last):
File "callCodeml.py", line 191, in <module>
main()
File "callCodeml.py", line 178, in main
run(path_seq, name)
File "callCodeml.py", line 140, in run
res_null = call_codeml('null', path_seq, name)
File "callCodeml.py", line 117, in call_codeml
b = subprocess.Popen(['codeml', f'{path0}/WorkingDrictory_{start_time}/{name}/{type}/{type}.ctl'], stdout=subprocess.PIPE)
File "C:\Users\yangz\anaconda3\lib\subprocess.py", line 858, in __init__
self._execute_child(args, executable, preexec_fn, close_fds,
File "C:\Users\yangz\anaconda3\lib\subprocess.py", line 1311, in _execute_child
hp, ht, pid, tid = _winapi.CreateProcess(executable, args,
FileNotFoundError: [WinError 2] 系統(tǒng)找不到指定的文件。
能否指教什么問題噩翠，找不到指定文件？選擇壓力分析伤锚，從序列下載到結(jié)果繪圖
選擇壓力及基因在進(jìn)化過程中所受到的壓力擅笔，也稱自然選擇。 在遺傳學(xué)中屯援， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同義突變頻率(Ka)和同義突變頻率（Ks）之間的比例猛们。 一般認(rèn)為，同義...
