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    2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載原始測(cè)序數(shù)據(jù)

    記錄下下載過(guò)程,為自己和后人避坑。 1.Conda連接不上鏡像源問(wèn)題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時(shí)遇到的問(wèn)題撕彤。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報(bào)錯(cuò)。 嘗試了很...

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    2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載原始測(cè)序數(shù)據(jù)

    記錄下下載過(guò)程梯捕,為自己和后人避坑掰派。 1.Conda連接不上鏡像源問(wèn)題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時(shí)遇到的問(wèn)題维费。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報(bào)錯(cuò)怔毛。 嘗試了很...

  • 哈哈哈员萍,沒(méi)錯(cuò),也就看看

    Perl編程練習(xí)—雙重哈希拣度、哈希數(shù)組

    前幾天晚上在練習(xí)Perl編程時(shí)突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數(shù)組碎绎。對(duì)這一類的問(wèn)題的解決瞬間開(kāi)拓了新思路蜂莉。這兩天利用雙重哈希/哈希數(shù)組解決了一些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換中的一些小問(wèn)題。記錄分享一...

  • 雙重哈匣炻眩看著有點(diǎn)暈??

    Perl編程練習(xí)—雙重哈希、哈希數(shù)組

    前幾天晚上在練習(xí)Perl編程時(shí)突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數(shù)組窖张。對(duì)這一類的問(wèn)題的解決瞬間開(kāi)拓了新思路幕随。這兩天利用雙重哈希/哈希數(shù)組解決了一些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換中的一些小問(wèn)題。記錄分享一...

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    190926【R語(yǔ)言作圖】實(shí)時(shí)定量PCR(RT_PCR)

    ① 輸入ct值梢卸,直接導(dǎo)出帶誤差線的柱狀圖。② 使用到的R包副女,"pcr",官方包的安裝和使用教程詳見(jiàn):https://www.rdocumentation.org/packag...

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    stringtie merge與gene_id

    1.不進(jìn)行merge的pipeline stringtie官方說(shuō)明文檔中說(shuō)明如果對(duì)新的異構(gòu)體不感興趣蛤高,可以使用下面簡(jiǎn)單的pipeline進(jìn)行定量,而不進(jìn)行merge 也就是說(shuō)...

  • 或者是bed文件里染色體編號(hào)和gff文件中染色體編號(hào)不一樣

    jcvi作圖二(共線性)

    一:數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 還是用到上一步生成的ath.aly.anchors和ath.aly.anchors.new文件 1. 創(chuàng)建如下三個(gè)文件 seqids: 需要展現(xiàn)哪些序列 lay...

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    STEP4: 得到表達(dá)矩陣的流程

    SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個(gè)步驟而已棋返,中間穿插一些質(zhì)控的手段延都,每個(gè)步驟選擇好合適的軟件即可“米颍可以參考:一個(gè)植物轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目的實(shí)戰(zhàn) http://www...

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    48個(gè)實(shí)用的生信在線工具

    在線工具一般具有“功能強(qiáng)大簿姨、操作簡(jiǎn)單距误、無(wú)需安裝簸搞、用完就走”的特點(diǎn),輕松實(shí)現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”准潭。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...

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