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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數據庫中下載原始測序數據記錄下下載過程，為自己和后人避坑。 1.Conda連接不上鏡像源問題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時遇到的問題板乙。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報錯关划。 嘗試了很...
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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數據庫中下載原始測序數據記錄下下載過程全封，為自己和后人避坑拣凹。 1.Conda連接不上鏡像源問題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時遇到的問題弄匕。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報錯础浮。 嘗試了很...
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哈哈哈帆调，沒錯，也就看看
Perl編程練習—雙重哈希豆同、哈希數組
前幾天晚上在練習Perl編程時突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數組番刊。對這一類的問題的解決瞬間開拓了新思路。這兩天利用雙重哈希/哈希數組解決了一些數據轉換中的一些小問題影锈。記錄分享一...
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雙重哈锨畚瘢看著有點暈??
Perl編程練習—雙重哈希、哈希數組
前幾天晚上在練習Perl編程時突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數組鸭廷。對這一類的問題的解決瞬間開拓了新思路枣抱。這兩天利用雙重哈希/哈希數組解決了一些數據轉換中的一些小問題。記錄分享一...
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190926【R語言作圖】實時定量PCR(RT_PCR)① 輸入ct值宵晚，直接導出帶誤差線的柱狀圖垂攘。② 使用到的R包，"pcr",官方包的安裝和使用教程詳見：https://www.rdocumentation.org/packag...
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stringtie merge與gene_id1.不進行merge的pipeline stringtie官方說明文檔中說明如果對新的異構體不感興趣淤刃，可以使用下面簡單的pipeline進行定量晒他，而不進行merge 也就是說...
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或者是bed文件里染色體編號和gff文件中染色體編號不一樣
jcvi作圖二（共線性）
一：數據準備 還是用到上一步生成的ath.aly.anchors和ath.aly.anchors.new文件 1. 創(chuàng)建如下三個文件 seqids: 需要展現(xiàn)哪些序列 lay...
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北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優(yōu)铝侵，搜索全局最優(yōu)
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STEP4: 得到表達矩陣的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個步驟而已，中間穿插一些質控的手段疟丙，每個步驟選擇好合適的軟件即可颖侄。可以參考：一個植物轉錄組項目的實戰(zhàn) http://www...
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<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.cnblogs.com%2Fwangprince2017%2F" target="_blank">https://www.cnblogs.com/wangprince2017/</a> 博客園<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Fu010608296" target="_blank">https://blog.csdn.net/u010608296</a> CSDN<br><br>學者網<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fwww.scholat.com%2Fwangchuang" target="_blank">http://www.scholat.com/wangchuang</a><br><br>研究之門ReseearchGate<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.researchgate.net%2Fprofile%2FWang_Chuang9" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9</a><br><br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbbs.sciencenet.cn%2Fhome.php%3Fmod%3Dspace%26uid%3D944416%26view%3Dwc12436109" target="_blank">http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=944416&view=wc12436109</a> 科學網
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48個實用的生信在線工具
在線工具一般具有“功能強大、操作簡單悼泌、無需安裝、用完就走”的特點夹界，輕松實現(xiàn)“用別人的服務器分析自己的數據”馆里。 基因結構繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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