你好呀禁漓,請問使用HiFi+Utralong_nocorrect+HiC組裝后需要polish嗎技肩,我認為是不用吧看疗,但又不太確定
「基因組」hifiasm重大更新:支持Utralong ONT數(shù)據(jù)組裝hifiasm下載地址 截止今天為止,hifiasm官網(wǎng)更到0.19.3版本(五天前更新A仕弧!!):https://github.com/chhylp123/hifiasm/r...
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hifiasm下載地址 截止今天為止莺债,hifiasm官網(wǎng)更到0.19.3版本(五天前更新!G┴病齐邦!):https://github.com/chhylp123/hifiasm/r...
請問一下丐吓,我們該如何確定祖先染色體數(shù)量嘞浅悉,結果中有數(shù)百個CAR
使用Agora/ANGEs構建祖先核型0.忘了是在那篇文獻看到的,用了Agora券犁,再把Agora的輸出結果喂給ANGEsAgora和ANGEs都是構建祖先核型的軟件個人實測是Agora構建的結果太碎了, ANGE...
Multiple Sequentially Markovian Coalescent (MSMC)是一種利用馬爾可夫模型推斷群體動態(tài)歷史和群體結構的算法。能夠通過輸入基因組序...
同問,很奇怪蹲盘,第二種情況-G 不應該直接對應的reference annotation嗎股毫,因為我像文中用的循環(huán)變量是1.1生成的“=$id/$id'.gtf'”,輸出文件里面全部是STRG編號的geneid召衔,沒有生成與原始reference annotation的geneid對應關系的表铃诬,這樣就無法知道哪個STRG對應reference annotation的哪個基因,所以感覺似乎不太對苍凛?或者是我沒理解對趣席?有大神能解答一下不
Stringtie的使用說明參考文獻:stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads幫助文...
你好呀宣肚,請問是不是在計算群體結構前要進行連鎖不平衡過濾呢,意思就是用來計算群體結構的點不能是有連鎖不平衡的悠栓,這樣理解對嗎
玉米全基因關聯(lián)分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因組關聯(lián)分析是基于數(shù)量性狀連鎖不平衡理論霉涨,通過表型與基因型關聯(lián)分析獲得影響表型性狀的顯著關聯(lián)標記。 1. 軟件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...