大家經(jīng)常在文獻(xiàn)中看到非常好看的序列比對(duì)圖，現(xiàn)在筆者將目前見(jiàn)過(guò)的最好看的序列比對(duì)圖的作圖方法作分享，希望對(duì)大家的科研工作有所幫助，效果圖如下： 1.在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)、Genbank...
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做出漂亮的序列比對(duì)alignment圖——ENDscript/ESPript -
再肝一個(gè)R包！一行代碼繪制精美火山圖！一行代碼繪制火山圖的R包誕生了引润！在過(guò)去的一年中，師兄先后生信繪圖系列和高分SCI復(fù)現(xiàn)系列中更新了多種不同的火山圖的繪制方法痒玩，包括普通的火山圖淳附、漸變火山圖、以及包含GO通路信息...
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雙曲線(xiàn)火山圖一鍵拿捏日常瞎掰 ??火山圖作為展示差異基因的首選蠢古，可以說(shuō)是生信分析常見(jiàn)的圖形了燃观。常規(guī)的火山圖會(huì)在x、y軸方向上添加垂直參考線(xiàn)便瑟，以方便區(qū)分滿(mǎn)足閾值的差異基因。常規(guī)的火山圖這里就不多了...
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生信常用分析圖形繪制02 -- 解鎖火山圖真諦番川！有了R語(yǔ)言的基礎(chǔ)到涂，以及ggplot2繪圖基礎(chǔ)脊框，我們的生信常用分析圖形的繪制就可以提上日程了！本系列践啄，師兄就開(kāi)始帶著大家一起學(xué)習(xí)如何用R語(yǔ)言繪制我們自己的各種分析圖吧浇雹！ 由于本...
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GeneDoc | 多序列比對(duì)總結(jié)
1?? 比對(duì)軟件對(duì)fasta 序列進(jìn)行比對(duì)??比對(duì)方法可以有MEGA(ClustalW，Muscle), ClustalX以及MAFFT等軟件屿讽。還可以用GeneDoc軟件自身進(jìn)...
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利用GeneDoc美化同源比對(duì)結(jié)果軟件準(zhǔn)備：GeneDoc下載地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
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GeneDoc繪制漂亮的多重序列比對(duì)圖由于軟件的功能限制昭灵，一些比對(duì)軟件生成的比對(duì)文件，如Clustalx的*.aln文件伐谈，可讀性差烂完，無(wú)法滿(mǎn)足高質(zhì)量期刊的要求。因此诵棵，在實(shí)際操作過(guò)程中抠蚣，需要對(duì)一些多重序列比對(duì)的文件進(jìn)...
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ClustalX+GeneDoc繪制多重序列比對(duì)圖多重序列比對(duì)是對(duì)三個(gè)以上的生物學(xué)序列所作的序列比對(duì)。利用ClustalX可以進(jìn)行多重序列比對(duì)履澳，結(jié)合GeneDoc可繪制出漂亮的多重序列比對(duì)圖嘶窄，滿(mǎn)足高質(zhì)量期刊的要求。 ...
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