發(fā)簡信
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FeaturePlot 對負值并不友好??Seurat的FeaturePlot可以展示基因在降維空間里各個分群的表達情況，也可以展示metadata里面的數(shù)據(jù)情況菱涤，例如基因集打分情況...
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riborex：差異翻譯基因分析??分析差異翻譯基因時，為了保證結果的正確性慕购，除了使用Xtail軟件外震桶，也用riborex分析了一遍，該軟件封裝了常規(guī)轉錄組常用的三種差異分析框...
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Tips：ChIPseeker注釋的peak文件不要隨意命名??ChIPseeker用來做peak注釋體驗感確實很好毫蚓，所以也經(jīng)常用占键，為此還特意包裝了一個性化腳本方便命令行直接使用，后臺也有不少人獲取腳本元潘，...
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xtail | 差異翻譯基因分析??基因翻譯畔乙，即遺傳密碼從轉錄本到蛋白質的過程，也是功能基因能夠發(fā)揮自身作用前的必經(jīng)之路翩概∩啵基因的翻譯效率收到很多因素的調控，這其中最直接的是基因...
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ChIPseeker個性化注釋腳本修復??之前的推文[個性化ChIPseeker注釋peak結果[http://www.reibang.com/p/f1307325d8a2]]里面...
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TCellSI：巧用housekeeping genes矯正樣本間效應??TCellSI：一款借助Mann-Whitney U統(tǒng)計量钥庇，通過特定marker基因集和背景基因牍鞠，對T細胞狀態(tài)進行評估打分的軟件。該軟件能夠...
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PCA：這樣應該懂了吧评姨！??在RNA-seq分析結果中經(jīng)常會看到由兩個主成分(PC1难述，PC2)繪制的PCA (principal component analysis)...
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R tips：Seurat應該這么讀取多樣本"槍響了""看到是誰開的槍了嗎""看不清，他站在道德的制高點上，他在陽光下胁后。"????????????????????——溫特伯格《狩獵》 ??...
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