大家經(jīng)常在文獻(xiàn)中看到非常好看的序列比對(duì)圖,現(xiàn)在筆者將目前見(jiàn)過(guò)的最好看的序列比對(duì)圖的作圖方法作分享,希望對(duì)大家的科研工作有所幫助谒养,效果圖如下: 1.在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)丽啡、Genbank...
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一行代碼繪制火山圖的R包誕生了拟糕!在過(guò)去的一年中,師兄先后生信繪圖系列和高分SCI復(fù)現(xiàn)系列中更新了多種不同的火山圖的繪制方法尘喝,包括普通的火山圖磁浇、漸變火山圖、以及包含GO通路信息...
日常瞎掰 ??火山圖作為展示差異基因的首選朽褪,可以說(shuō)是生信分析常見(jiàn)的圖形了置吓。常規(guī)的火山圖會(huì)在x、y軸方向上添加垂直參考線缔赠,以方便區(qū)分滿足閾值的差異基因衍锚。常規(guī)的火山圖這里就不多了...
有了R語(yǔ)言的基礎(chǔ)橡淑,以及ggplot2繪圖基礎(chǔ)构拳,我們的生信常用分析圖形的繪制就可以提上日程了咆爽!本系列梁棠,師兄就開(kāi)始帶著大家一起學(xué)習(xí)如何用R語(yǔ)言繪制我們自己的各種分析圖吧! 由于本...
1?? 比對(duì)軟件對(duì)fasta 序列進(jìn)行比對(duì)??比對(duì)方法可以有MEGA(ClustalW斗埂,Muscle), ClustalX以及MAFFT等軟件符糊。還可以用GeneDoc軟件自身進(jìn)...
軟件準(zhǔn)備:GeneDoc下載地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
由于軟件的功能限制,一些比對(duì)軟件生成的比對(duì)文件呛凶,如Clustalx的*.aln文件男娄,可讀性差,無(wú)法滿足高質(zhì)量期刊的要求漾稀。因此模闲,在實(shí)際操作過(guò)程中,需要對(duì)一些多重序列比對(duì)的文件進(jìn)...
多重序列比對(duì)是對(duì)三個(gè)以上的生物學(xué)序列所作的序列比對(duì)崭捍。利用ClustalX可以進(jìn)行多重序列比對(duì)尸折,結(jié)合GeneDoc可繪制出漂亮的多重序列比對(duì)圖,滿足高質(zhì)量期刊的要求殷蛇。 ...