R語(yǔ)言的主成分分析(PCA)詳解和帶聚類(lèi)的PCA圖繪制 最近有個(gè)老師在整理文章數(shù)據(jù),由于分組較多,想展示PCA圖,說(shuō)明不同分組的差異次兆,公司默認(rèn)給出的PCA圖比較樸素,想做的好...
本文來(lái)源于微信公眾號(hào)SCI狂人,版權(quán)歸SCI狂人團(tuán)隊(duì)所有羽峰,更多資料可以關(guān)注微信公眾號(hào)SCI狂人 投過(guò)了SCI期刊的小伙伴都知道趟咆,在投稿的時(shí)候需要寫(xiě)cover letter。如...
GEO數(shù)據(jù)挖掘或轉(zhuǎn)錄組分析差異表達(dá)[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因時(shí)值纱,結(jié)果中...
在簡(jiǎn)書(shū) 土豆學(xué)生信 分享的內(nèi)容看到這篇論文 簡(jiǎn)書(shū)的鏈接是 http://www.reibang.com/p/bbf9cb13b41a[https://www.jianshu...
閱讀癌癥基因相關(guān)文章的時(shí)候,總是會(huì)遇到類(lèi)似的圖: 查資料許久惰聂,看看用ggplot2當(dāng)中的 geom_jitter能不能實(shí)現(xiàn)疆偿。但是,不幸搓幌。沒(méi)有嘗試成功杆故。 然后就開(kāi)始查閱資料啦 ...
相信大家都用Excel處理過(guò)數(shù)據(jù),對(duì)于使用R的人來(lái)說(shuō)溉愁,更是經(jīng)常需要從Excel中把數(shù)據(jù)讀入到R中做進(jìn)一步處理处铛。雖然Excel統(tǒng)計(jì)和繪圖也很強(qiáng)大,但是還是是有一些局限性的。 R...
我相信大家在看文章的時(shí)候都見(jiàn)過(guò)下面這樣的圖奕塑,這張圖實(shí)際上是由5張子圖經(jīng)過(guò)排版而拼接起來(lái)的。 一般發(fā)文章的時(shí)候枫疆,編輯也會(huì)要求你將相關(guān)的圖拼接在一起來(lái)說(shuō)明同一個(gè)問(wèn)題爵川,不會(huì)讓你單獨(dú)...
之前有人在公眾號(hào)留言問(wèn)文章開(kāi)頭這幅圖如何實(shí)現(xiàn),下面的B圖是折線(xiàn)圖加柱形圖息楔,相對(duì)比較容易實(shí)現(xiàn)寝贡,上面的A圖稍微有點(diǎn)復(fù)雜,我想到的辦法是拼圖值依,圖A可以看成三個(gè)熱圖圃泡,然后加一個(gè)堆積柱...
作為一個(gè)生物學(xué)家(zha)辆亏,差異表達(dá)分析似乎是一項(xiàng)必備的技能风秤。然鵝對(duì)于一個(gè)沒(méi)有任何編程基礎(chǔ)的生物學(xué)家,寫(xiě)代碼是那么神秘莫測(cè)而又遙不可及扮叨,讓人腦殼疼缤弦。那么今天小編就為大家介紹一...
今天查資料的時(shí)候發(fā)現(xiàn)的,好多漂亮的圖片彻磁,大部分都是借助ggplot2實(shí)現(xiàn)的碍沐。提供示例數(shù)據(jù)和代碼。很好的R語(yǔ)言畫(huà)圖學(xué)習(xí)資料衷蜓。 這份學(xué)習(xí)資料里我比較感興趣的是以下兩幅圖累提,第一幅是...
有一些已經(jīng)做完了GO enrichment, 得到了結(jié)果,才發(fā)現(xiàn)很多軟件都是直接給gene list做富集磁浇。如果已經(jīng)完成分析斋陪,照樣可以畫(huà)圖,代碼如下: 原始文件示例:Anno...
一、常用的特征縮放算法有兩種: 歸一化(normalization)和標(biāo)準(zhǔn)化(standardization) 二交洗、歸一化(normalization) 1骑科、什么是歸一化 歸...