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R語(yǔ)言的主成分分析（PCA）詳解和帶聚類(lèi)的PCA圖繪制 最近有個(gè)老師在整理文章數(shù)據(jù)，由于分組較多，想展示PCA圖，說(shuō)明不同分組的差異，公司默認(rèn)給出的PCA圖比較樸素，想做的好...

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GEO數(shù)據(jù)挖掘或轉(zhuǎn)錄組分析差異表達(dá)[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因時(shí)，結(jié)果中...

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在簡(jiǎn)書(shū) 土豆學(xué)生信 分享的內(nèi)容看到這篇論文 簡(jiǎn)書(shū)的鏈接是 http://www.reibang.com/p/bbf9cb13b41a[https://www.jianshu...

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閱讀癌癥基因相關(guān)文章的時(shí)候蛤克，總是會(huì)遇到類(lèi)似的圖： 查資料許久捺癞，看看用ggplot2當(dāng)中的 geom_jitter能不能實(shí)現(xiàn)。但是构挤，不幸髓介。沒(méi)有嘗試成功。 然后就開(kāi)始查閱資料啦 ...

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相信大家都用Excel處理過(guò)數(shù)據(jù)筋现，對(duì)于使用R的人來(lái)說(shuō)唐础，更是經(jīng)常需要從Excel中把數(shù)據(jù)讀入到R中做進(jìn)一步處理。雖然Excel統(tǒng)計(jì)和繪圖也很強(qiáng)大矾飞，但是還是是有一些局限性的一膨。 R...

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我相信大家在看文章的時(shí)候都見(jiàn)過(guò)下面這樣的圖洒沦，這張圖實(shí)際上是由5張子圖經(jīng)過(guò)排版而拼接起來(lái)的豹绪。 一般發(fā)文章的時(shí)候，編輯也會(huì)要求你將相關(guān)的圖拼接在一起來(lái)說(shuō)明同一個(gè)問(wèn)題申眼，不會(huì)讓你單獨(dú)...

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之前有人在公眾號(hào)留言問(wèn)文章開(kāi)頭這幅圖如何實(shí)現(xiàn)瞒津，下面的B圖是折線圖加柱形圖蝉衣，相對(duì)比較容易實(shí)現(xiàn)，上面的A圖稍微有點(diǎn)復(fù)雜巷蚪，我想到的辦法是拼圖病毡，圖A可以看成三個(gè)熱圖，然后加一個(gè)堆積柱...

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棒棒糖圖 教程：https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1603957858&ver=2673&signature=BHAEP...

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作為一個(gè)生物學(xué)家(zha)功戚，差異表達(dá)分析似乎是一項(xiàng)必備的技能。然鵝對(duì)于一個(gè)沒(méi)有任何編程基礎(chǔ)的生物學(xué)家似嗤，寫(xiě)代碼是那么神秘莫測(cè)而又遙不可及，讓人腦殼疼届宠。那么今天小編就為大家介紹一...

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今天查資料的時(shí)候發(fā)現(xiàn)的烁落，好多漂亮的圖片，大部分都是借助ggplot2實(shí)現(xiàn)的豌注。提供示例數(shù)據(jù)和代碼伤塌。很好的R語(yǔ)言畫(huà)圖學(xué)習(xí)資料。 這份學(xué)習(xí)資料里我比較感興趣的是以下兩幅圖轧铁，第一幅是...

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有一些已經(jīng)做完了GO enrichment, 得到了結(jié)果每聪，才發(fā)現(xiàn)很多軟件都是直接給gene list做富集。如果已經(jīng)完成分析齿风，照樣可以畫(huà)圖药薯，代碼如下： 原始文件示例：Anno...