生信在線數(shù)據(jù)庫
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一些生物信息學(xué)用到的軟件钻蹬，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades凭需、canu等等 ?? 序列比對比如blast问欠、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對比如mega粒蜈、clustalW顺献、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS枯怖、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree注整、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK度硝、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o肿轨、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC、BUSCO蕊程、QUAST ?? 可視化工具比如IGV萝招、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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