一個(gè)長(zhǎng)著一雙大耳朵跨行做金融，的工科博士隶垮，因?yàn)樾盏脑蚪?jīng)常被人稱為大耳朵圖圖，大耳朵圖圖希望用自己的文章記錄下日常的所學(xué)所思所想概作。<br> 更多關(guān)于專業(yè)領(lǐng)域的內(nèi)容還請(qǐng)大家關(guān)注公眾號(hào)：大耳朵博士雜談怀薛！<br>
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跟著Cell學(xué)作圖：R語(yǔ)言ggplot2作圖展示差異表達(dá)的基因一組對(duì)照加處理這種實(shí)驗(yàn)的差異表達(dá)分析結(jié)果通常是用火山圖來展示携丁，如果是很多組實(shí)驗(yàn)的話如何展示琢歇，這種情況我之前還沒有遇到過。公眾號(hào)后臺(tái)有讀者留言問到了如下的圖 這個(gè)圖來自于論文A...
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R語(yǔ)言ggplot2做柱形圖展示富集分析的結(jié)果做完轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)或者其他的一些分析拿到一些基因名稱之后下一步通常是做一些注釋梦鉴，比如GO或者KEGG的注釋李茫，注釋好以后通常是富集分析。如果是研究比較多的物種肥橙，可以直接使用R語(yǔ)...
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Statquest學(xué)習(xí)筆記|在R中進(jìn)行PCA（主成分分析）學(xué)習(xí)利用prcomp()進(jìn)行PCA（主成分分析）利用base graghics和ggplot2來繪制PCA圖確定每個(gè)成分的描述的差異找到影響最大的變量 建立模擬數(shù)據(jù)集 首先建...
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R-ggplot2-箱圖系列（2） 注釋P值與組間比較R-ggplot2-箱圖系列（1） basic - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/bafbd08b28ef]R-ggp...
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Cytoscape中文教程（3）Step by step 3鑒定一系列感興趣的基因。 典型的是椭坚，這些基因是對(duì)你的實(shí)驗(yàn)調(diào)節(jié)反應(yīng)比較強(qiáng)烈的基因（也就是差異基因）予跌。下面講描述三種和這些基因相關(guān)的輸入網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)到cy...
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任何人！一鍵完成物種間的共線性分析與可視化寫在前面 類似的主題善茎，我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性（MCScanX）分析》的文章券册。推出之后一部分人用著挺好。也有相當(dāng)部分朋友卻不知為何遇到各種各樣的問題。這些問題...
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利用ggcor包繪制相關(guān)性組合圖及環(huán)狀熱圖ggcor包最初是因?yàn)槟芸焖賹?shí)現(xiàn)19年Science一組合相關(guān)性圖(上圖所示)變得流行起來，除此該包對(duì)熱圖媒楼、熱圖等等的可視化都是很方便快捷的乐尊，除了之前介紹過的幾種相關(guān)性圖幾種...
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ggplot2繪制KEGG富集散點(diǎn)圖散點(diǎn)圖是 KEGG 富集分析結(jié)果的圖形化展示方式夺颤。在此圖中痢缎，KEGG 富集程度通過 rich factor, qvalue 和富集到此通路上的基因個(gè)數(shù)來衡量。其中 rich ...
