小明的數據分析筆記本

一組對照加處理這種實驗的差異表達分析結果通常是用火山圖來展示辰如，如果是很多組實驗的話如何展示寝姿，這種情況我之前還沒有遇到過胞谈。公眾號后臺有讀者留言問到了如下的圖 這個圖來自于論文A...

小明的數據分析筆記本

做完轉錄組差異表達或者其他的一些分析拿到一些基因名稱之后下一步通常是做一些注釋成翩，比如GO或者KEGG的注釋，注釋好以后通常是富集分析辰妙。如果是研究比較多的物種，可以直接使用R語...

亞里亞的塔

學習利用prcomp()進行PCA（主成分分析）利用base graghics和ggplot2來繪制PCA圖確定每個成分的描述的差異找到影響最大的變量 建立模擬數據集 首先建...

小貝學生信

R-ggplot2-箱圖系列（1） basic - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/bafbd08b28ef]R-ggp...

生信擺渡

https://r-pkgs.org/index.html[https://r-pkgs.org/index.html] 準備 安裝 Rtools[http://cran.r...

Y大寬

Step by step 3鑒定一系列感興趣的基因魂贬。 典型的是，這些基因是對你的實驗調節(jié)反應比較強烈的基因（也就是差異基因）裙顽。下面講描述三種和這些基因相關的輸入網絡數據到cy...

生信石頭

寫在前面 類似的主題，我們已經推出了一篇主題為《一鍵完成共線性（MCScanX）分析》的文章愈犹。推出之后一部分人用著挺好键科。也有相當部分朋友卻不知為何遇到各種各樣的問題。這些問題...

凱凱何_Boy

ggcor包最初是因為能快速實現19年Science一組合相關性圖(上圖所示)變得流行起來漩怎，除此該包對熱圖勋颖、熱圖等等的可視化都是很方便快捷的，除了之前介紹過的幾種相關性圖幾種...