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這里是佳奧<br><br>有疑問歡迎email或yuque平臺<br><br>專注多組學(xué)挖掘基因，以及非模式植物的下游注釋以及可視化工作
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 實戰(zhàn)】十一、復(fù)現(xiàn)文章分析結(jié)果這里是佳奧！ 我們進(jìn)入到作者的GitHub下載一下代碼來看看吧钧萍。 1 作者原始代碼 當(dāng)然，由于package的版本日新月異政鼠，除非安裝相同版本的package风瘦，我就不運行了，作...
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稀疏矩陣什么是稀疏矩陣矩陣中有很多零公般，其中非零元素只是占了一小部分万搔，大部分都是零，這種就叫稀疏矩陣俐载。稀疏矩陣概念沒有嚴(yán)格的界定蟹略，0 的個數(shù)/在矩陣元素總數(shù)中占的百分比沒有嚴(yán)格的規(guī)定，...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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R語言繪圖包10--Circos圖的繪制：circlize包R語言繪圖包系列： R語言繪圖包01--優(yōu)秀的拼圖包patchwork[http://www.reibang.com/p/e57555d48c91] R語言繪圖包02--熱...
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DepMap數(shù)據(jù)庫DepMap（Cancer Dependency Map project） https://depmap.org/portal/[https://depmap.org/por...
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scanpy數(shù)據(jù)整合批次效應(yīng)去除原理引用：葬花樸[https://www.cnblogs.com/listen2099/] 1.scanpy.external.pp.mnn_correct** 第一步：將表達(dá)量...
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轉(zhuǎn)錄組DEGs聚類熱圖和功能富集分析寫在前面：經(jīng)常做轉(zhuǎn)錄組分析膛虫，就是把差異基因搞個火山圖和Venn圖看各組差異基因的共有和特有情況草姻。看見有個比較好的選擇稍刀，能直觀比較各種處理帶來的影響撩独，如下： 來自Nature ...
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【生信實戰(zhàn)】scRNA單細(xì)胞/ST空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞注釋完全指導(dǎo)手冊隨著單細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展和普及综膀，越來越多的課題組開始使用單細(xì)胞技術(shù)進(jìn)行自己的課題研究。然而局齿，在單細(xì)胞的注釋上剧劝，商業(yè)公司提供的流程化注釋往往難以滿足實際的需求，甚至得到牛頭不對馬嘴...
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愿同你一起分享在生信分析和精品咖啡上的點滴！
