IP屬地：福建
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基因組重復(fù)序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用RepeatMasker是重復(fù)序列檢測的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對來準(zhǔn)確識別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列钮莲，屬于同源預(yù)測注釋的方式免钻。下文除了RepeatMasker的使...
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用TBtools极舔，快速高效實(shí)現(xiàn)基因組共線性分析與可視化， 贊链瓦！寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴拆魏，可以通過以下幾段內(nèi)容，了解一下慈俯，我為什么要費(fèi)勁巴拉畫出這樣一張圖渤刃。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
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研究生卖子，常做實(shí)驗(yàn)，生信小白刑峡。
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總結(jié)各種生物科研工具使用經(jīng)驗(yàn)
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公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組阳似、腫瘤免疫、單細(xì)胞組學(xué)
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Beast系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和分化時(shí)間的估算(上)以下內(nèi)容參考了同研究組師弟整理的筆記、和網(wǎng)絡(luò)資源：Beast v1.8簡易手冊-修訂版 · 語雀 (yuque.com)[https://www.yuque.com/wush...
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一條小咸魚
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用MrBayes構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹操作步驟整理總結(jié)
最近在學(xué)習(xí)構(gòu)建進(jìn)化樹，嘗試了用PHYML構(gòu)建ML樹和用MrBayes構(gòu)建貝葉斯樹户矢，因?yàn)闃?gòu)建ML樹時(shí)用的是網(wǎng)站的PHYML進(jìn)行的玲献，操作簡便，所以就未做整理，只詳細(xì)整理了一下貝葉...
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選擇壓力分析，從序列下載到結(jié)果繪圖選擇壓力及基因在進(jìn)化過程中所受到的壓力礼预，也稱自然選擇眠砾。 在遺傳學(xué)中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同義突變頻率(Ka)和同義突變頻率（Ks）之間的比例托酸。 一般認(rèn)為褒颈，同義...
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mVISTA格式文件：由Perl腳本處理GenBank注釋文件而來
Bioinformatic_Scripts/get_mVISTA_format_from_GenBank_annotation 1、簡要說明 mVISTA是常用的葉綠體基因組...
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答讀者問~使用R語言利用SSR數(shù)據(jù)構(gòu)建進(jìn)化樹今天公眾號的一位讀者留言問有了SSR的數(shù)據(jù)励堡，如何畫樹狀圖谷丸？ SSR的數(shù)據(jù)我也是第一次接觸，我看了一下他發(fā)給我的數(shù)據(jù)应结，是csv格式刨疼，每行是一個樣本，每列是一個位點(diǎn)摊趾。位點(diǎn)的取值是...
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植物分類學(xué)網(wǎng)站推薦
本文章意在列舉一些植物分類學(xué)研究過程中常用的互聯(lián)網(wǎng)在線資源。 1. 植物志 1.1 國內(nèi)植物志 中國植物志[http://frps.iplant.cn/] Flora of ...
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系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建簡明教程1. 前言 構(gòu)建一棵系統(tǒng)發(fā)育樹是研究系統(tǒng)學(xué)和進(jìn)化的基礎(chǔ)肛炮。然而止吐，發(fā)育樹的構(gòu)建是對分類單元進(jìn)化歷史的推測，因此對發(fā)育樹的可靠性檢驗(yàn)也是重中之重侨糟。一棵發(fā)育樹的獲得大致分為數(shù)據(jù)輸入碍扔、...
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Take care of yourself and be well!
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計(jì)算RSCU值并繪圖1.計(jì)算RSCU值 可以直接用pip安裝CAI 自己寫個RSCU.py計(jì)算RSCU值不同，當(dāng)然你也可以通過在線版EMBOSS[http://www.bioinformatics....
