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微信公眾號(hào)～小明學(xué)習(xí)室巷疼，主要分享如何利用醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表文章
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Lazygit的安裝與使用瘫筐。
使用LazyGit來(lái)管理你的項(xiàng)目墙基。 Git的強(qiáng)大是所有開發(fā)者都心知肚明的事情，但是其多樣的命令令人很是難受床牧。不過(guò)在Github上有著這么一個(gè)開源項(xiàng)目lazygit。 Lazy...
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2.2 愉快寫文檔：VSCode + Markdown Preview Enhanced本章導(dǎo)航： 1. 介紹 MPE遭贸。 2. 簡(jiǎn)要介紹幾個(gè)十分好用的 MPE 的功能戈咳。 使用電腦環(huán)境：Windows10。本章主要參考 MPE 官方中文文檔壕吹。 3.1 Markdo...
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高通量測(cè)序中慕的，read、contig和Scaffold分別是什么
1.什么是Reads? 高通量測(cè)序平臺(tái)產(chǎn)生的序列就稱為reads挤渔。 2.什么是Contig肮街？ 拼接軟件基于reads之間的overlap區(qū)，拼接獲得的序列稱為Contig（重...
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一文看懂三代組裝軟件——Flye
作者：童蒙編輯：angelica 一判导、介紹 Flye是用于單分子組裝數(shù)據(jù)的denovo基因組裝的軟件嫉父。這個(gè)軟件可以用于各種數(shù)據(jù)集，從小的細(xì)菌到大的哺乳動(dòng)物眼刃。 輸入是原始的Pa...
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multiple whole genome alignment寫在前面：在上億年的進(jìn)化歷程中绕辖，基因組經(jīng)歷了大大小小的改變。從小的核苷酸突變擂红、插入仪际、缺失到大的基因缺失、重復(fù)昵骤、基因組重排和水平基因轉(zhuǎn)移树碱。基因組比對(duì)可以通過(guò)比對(duì)序列中的同源區(qū)域...
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LASTZ說(shuō)明文檔（一）LASTZ說(shuō)明文檔(v1.04.15, Aug27 2021 build)本文參考自LASTZ發(fā)行版[http://www.bx.psu.edu/~rsharris/last...
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醫(yī)學(xué)事務(wù)部的前景及MSL是做什么的变秦？
1. 醫(yī)學(xué)事務(wù)部在公司的地位如何成榜？ 醫(yī)藥商業(yè)模式歷經(jīng)多次變化，從一開始的銷售驅(qū)動(dòng)蹦玫，到后續(xù)的市場(chǎng)驅(qū)動(dòng)赎婚，再至現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)驅(qū)動(dòng)刘绣。醫(yī)學(xué)驅(qū)動(dòng)（medical driven）是在2015年...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載GEO（GENE EXPRESSION OMNIBUS），https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/挣输，由美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心NCBI創(chuàng)建維護(hù)的纬凤，是...
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Seurat包之導(dǎo)入單細(xì)胞數(shù)據(jù)方式匯總挖掘公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)集時(shí)，會(huì)遇到常見(jiàn)各種單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)格式∑缃梗現(xiàn)總結(jié)如下移斩，方便自己日后調(diào)用，以創(chuàng)建Seurat對(duì)象（1）barcodes.tsv.gz绢馍、features.tsv....
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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Pacbio和Nanopore測(cè)序技術(shù)之拳王爭(zhēng)霸
作者:May審稿:童蒙編輯:amethyst 引言 大家好舰涌，又到了阿拉丁聊基因組的時(shí)間了猖任。今天我們按照上期的計(jì)劃，我們來(lái)聊一下基因組測(cè)序技術(shù)中的兩大神兵利器之--Pacbio...
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ggplot2學(xué)習(xí)（五）ggplot2基礎(chǔ)（5）——配色與圖例 參考《R數(shù)據(jù)可視化手冊(cè)》瓷耙、《R繪圖：一文了解ggplot2顏色的設(shè)置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
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2021-03-11 測(cè)序線性化深度圖有關(guān)步驟可以參考之前的2020-04-23 繪制Circos圖之二 測(cè)序深度http://www.reibang.com/p/ce76f043b45f[https://ww...
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Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖一朱躺、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作搁痛，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì)：Bedtolols inter...
