原文載于生信技能樹我寫此文是為了致敬生信技能樹團隊！感謝他們無私分享科侈！ 以下是生信技能樹學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會遇到Affymetrix Human Transcrip...
IP屬地：貴州
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GPL17586飒赃、GPL19251和GPL16686平臺芯片ID轉(zhuǎn)換
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微信公眾號～小明學(xué)習(xí)室，主要分享如何利用醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)庫發(fā)表文章
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Lazygit的安裝與使用权薯。
使用LazyGit來管理你的項目姑躲。 Git的強大是所有開發(fā)者都心知肚明的事情，但是其多樣的命令令人很是難受盟蚣。不過在Github上有著這么一個開源項目lazygit黍析。 Lazy...
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2.2 愉快寫文檔：VSCode + Markdown Preview Enhanced本章導(dǎo)航： 1. 介紹 MPE。 2. 簡要介紹幾個十分好用的 MPE 的功能屎开。 使用電腦環(huán)境：Windows10橄仍。本章主要參考 MPE 官方中文文檔。 3.1 Markdo...
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高通量測序中茁瘦，read品抽、contig和Scaffold分別是什么
1.什么是Reads? 高通量測序平臺產(chǎn)生的序列就稱為reads。 2.什么是Contig甜熔？ 拼接軟件基于reads之間的overlap區(qū)圆恤，拼接獲得的序列稱為Contig（重...
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一文看懂三代組裝軟件——Flye
作者：童蒙編輯：angelica 一、介紹 Flye是用于單分子組裝數(shù)據(jù)的denovo基因組裝的軟件腔稀。這個軟件可以用于各種數(shù)據(jù)集盆昙，從小的細(xì)菌到大的哺乳動物。 輸入是原始的Pa...
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multiple whole genome alignment寫在前面：在上億年的進化歷程中焊虏，基因組經(jīng)歷了大大小小的改變淡喜。從小的核苷酸突變、插入诵闭、缺失到大的基因缺失炼团、重復(fù)、基因組重排和水平基因轉(zhuǎn)移疏尿∥林ィ基因組比對可以通過比對序列中的同源區(qū)域...
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LASTZ說明文檔（一）LASTZ說明文檔(v1.04.15, Aug27 2021 build)本文參考自LASTZ發(fā)行版[http://www.bx.psu.edu/~rsharris/last...
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醫(yī)學(xué)事務(wù)部的前景及MSL是做什么的？
1. 醫(yī)學(xué)事務(wù)部在公司的地位如何润歉？ 醫(yī)藥商業(yè)模式歷經(jīng)多次變化模狭，從一開始的銷售驅(qū)動，到后續(xù)的市場驅(qū)動踩衩，再至現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)驅(qū)動嚼鹉。醫(yī)學(xué)驅(qū)動（medical driven）是在2015年...
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GEO數(shù)據(jù)庫下載GEO（GENE EXPRESSION OMNIBUS），https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/驱富，由美國國立生物技術(shù)信息中心NCBI創(chuàng)建維護的锚赤，是...
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Seurat包之導(dǎo)入單細(xì)胞數(shù)據(jù)方式匯總挖掘公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)集時，會遇到常見各種單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)格式『峙福現(xiàn)總結(jié)如下线脚，方便自己日后調(diào)用，以創(chuàng)建Seurat對象（1）barcodes.tsv.gz、features.tsv....
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努力努力再努力~<br>個人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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Pacbio和Nanopore測序技術(shù)之拳王爭霸
作者:May審稿:童蒙編輯:amethyst 引言 大家好，又到了阿拉丁聊基因組的時間了寓落。今天我們按照上期的計劃括丁，我們來聊一下基因組測序技術(shù)中的兩大神兵利器之--Pacbio...
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ggplot2學(xué)習(xí)（五）ggplot2基礎(chǔ)（5）——配色與圖例 參考《R數(shù)據(jù)可視化手冊》、《R繪圖：一文了解ggplot2顏色的設(shè)置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
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2021-03-11 測序線性化深度圖有關(guān)步驟可以參考之前的2020-04-23 繪制Circos圖之二 測序深度http://www.reibang.com/p/ce76f043b45f[https://ww...
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Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖一伶选、背景介紹 通常史飞，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計：Bedtolols inter...
