要分享就用點(diǎn)心，一大批代碼都是錯(cuò)誤的，你看代碼前后連接的起來(lái)嗎
RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（四）：差異分析前的準(zhǔn)備——數(shù)據(jù)檢查本節(jié)概覽：數(shù)據(jù)預(yù)處理, 進(jìn)行樣本間具有可比性boxplot查看樣本的基因整體表達(dá)情況查看不同分組的聚類情況：樣本hclust 圖焕阿、距離熱圖聋丝、PCA圖芳肌、差異基因熱圖接谨、相關(guān)性熱圖...
都2023了窝爪，你還在做傳統(tǒng)的ceRNA?老板指定的研究方向就是miRNA弛车，然而傳統(tǒng)的miRNA調(diào)控模式就爛大街了，成為批量生產(chǎn)SCI的超級(jí)“灌水”工具蒲每，基本沒(méi)有創(chuàng)新性可言纷跛，遇...
做代謝組研究，你一定會(huì)用到它——HMDB 人類代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)(HMDB)于2007年首次發(fā)布邀杏，被認(rèn)為是人類代謝研究的標(biāo)準(zhǔn)代謝組學(xué)資源贫奠，包含有關(guān)人類代謝物及其生物學(xué)作用、生理濃度...
1.構(gòu)建DESeq2對(duì)象 （1）從SummarizedExperiment對(duì)象構(gòu)建DESeqDataSet對(duì)象 se為RangedSummarizedExperiment對(duì)象...
由于實(shí)驗(yàn)人員勒叠、技術(shù)、環(huán)境膏孟、時(shí)間點(diǎn)眯分、芯片處理等各種因素原因，得到的芯片表達(dá)矩陣是含有非生物學(xué)因素差異的柒桑。有時(shí)候想分析兩組間差異弊决，但是一個(gè)數(shù)據(jù)集下面的樣本數(shù)量略少，因此想整合多個(gè)...
大佬請(qǐng)問(wèn)一下為什么expm之后，normalization 還persists
seurat-FindAllMarkers()源碼解析現(xiàn)在回想單細(xì)胞項(xiàng)目的一些常規(guī)分析界逛，clusters/groups間的差異表達(dá)分析（differential expression analysis）幾乎是分析必備項(xiàng)昆稿，F(xiàn)ind...
今天又是入門(mén)單細(xì)胞分析的一天在單細(xì)胞分析當(dāng)中，我們會(huì)用到兩個(gè)函數(shù)：NormalizeData()和ScaleData()畏陕，這兩個(gè)函數(shù)的區(qū)別到底在哪兒配乓？它們到底對(duì)我們的單細(xì)胞數(shù)...
SingleCellExperiment是通過(guò)SingleCellExperiment包創(chuàng)建的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析對(duì)象，已有幾十個(gè)單細(xì)胞R包支持惠毁。其衍生自SummarizedExp...
我想問(wèn)個(gè)問(wèn)題犹芹，rlog之后的數(shù)據(jù)可以直接拿來(lái)做limma分析嗎，因?yàn)閘imma要求輸入的是經(jīng)過(guò)log2轉(zhuǎn)化的鞠绰，
DESeq2詳細(xì)用法1.構(gòu)建DESeq2對(duì)象 （1）從SummarizedExperiment對(duì)象構(gòu)建DESeqDataSet對(duì)象 se為RangedSummarizedExperiment對(duì)象...
在實(shí)踐之前羽莺，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識(shí)點(diǎn)：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預(yù)測(cè)染色質(zhì)的類型（異...
What is HOMER丈挟？ HOMER is a software for motif discovery and ChIP-Seq analysis HOMER軟件是Li...
