又是17點咽斧，周日坛梁，適合休息典徊。這周周末沒回貴陽陪家人也就只能回辦公桌摸魚《潮纾或許是我的心態(tài)有變化蛋铆？當然，這并不影響诗芜。不能做大事瞳抓，那就做一些小事。索性把積累的一些小事逐個捋捋伏恐，一一...
IP屬地：黑龍江
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隨筆 | 如何「抹去」團隊成員的創(chuàng)造力與激情
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同源染色體片段檢測工具ColinearScan的使用寫在前面 更好的閱讀體驗請移步這里翠桦。確定染色體同源片段是基因組學研究的一個重要方面横蜒，有助于揭示基因組在歷史上發(fā)生的多種多樣的進化事件，如DNA復制秤掌、染色體重排愁铺、基因丟失等。研...
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測序數(shù)據(jù)的深度、覆蓋度等計算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強度有多大渠羞？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
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如何對基因組序列進行注釋基因組組裝完成后斤贰，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個問題次询，需要對基因組序列進行注釋荧恍。注釋之前首先得構建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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這個軟件想在集群上跑起來還是蠻難的
macos下安裝JCVI奇葩問題摹菠。
背景 JCVI不需要介紹了,唐海寶老師開發(fā)的python環(huán)境下的比較基因組學分析可視化利器。在依賴中可以看到需要matplotlib, 這哥們好像需要LaTeX,如果不裝La...
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三代轉錄組系列：使用Cogent重建基因組編碼區(qū)盡管目前已測序的物種已經(jīng)很多了，但是對于一些動輒幾個G的復雜基因組摘投，還沒有某個課題組有那么大的經(jīng)費去測序煮寡，所以仍舊缺少高質(zhì)量的完整基因組，那么這個時候一個高質(zhì)量的轉錄組還是能...
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物種內(nèi)共線性圈圖繪制跃须，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了娃兽！整天有人問菇民，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義投储？你想說談什么生物學故事第练？ 承認吧，你什么都不知道玛荞，什么都沒搞...
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測序數(shù)據(jù)質(zhì)控和預處理之fastp
1. 引言 下機的FASTQ數(shù)據(jù)通常需要進行質(zhì)控和預處理娇掏，以保證下游分析輸?shù)臏蚀_性。fastp軟件僅掃描數(shù)據(jù)文件一次勋眯，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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未明學院專注于通過項目制教學來教授學員數(shù)據(jù)分析&數(shù)據(jù)挖掘技能客蹋。本著讓學習更有趣塞蹭、讓學員的簡歷不再單薄的教學理念，未明學院為每一組學員設計緊跟企業(yè)界熱點的數(shù)據(jù)處理項目讶坯，通過項目制學習（PBL）的方式番电，讓學員在掌握數(shù)據(jù)處理技能的同時，收獲一個高含金量的項目經(jīng)歷辆琅。未明學院成立一年多來漱办，已經(jīng)幫助數(shù)千位學員實現(xiàn)簡歷的蛻變这刷，許多學員拿到了諸如中信證券、阿里巴巴等知名企業(yè)的全職offer洼冻，以及哥倫比亞大學崭歧，牛津大學等世界知名學府的研究生offer。
