又是17點窿侈，周日，適合休息墓猎。這周周末沒回貴陽陪家人也就只能回辦公桌摸魚胡诗〉讼撸或許是我的心態(tài)有變化？當然煌恢，這并不影響骇陈。不能做大事，那就做一些小事瑰抵。索性把積累的一些小事逐個捋捋你雌，一一...
IP屬地：甘肅
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隨筆 | 如何「抹去」團隊成員的創(chuàng)造力與激情
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同源染色體片段檢測工具ColinearScan的使用寫在前面 更好的閱讀體驗請移步這里婿崭。確定染色體同源片段是基因組學(xué)研究的一個重要方面拨拓，有助于揭示基因組在歷史上發(fā)生的多種多樣的進化事件，如DNA復(fù)制氓栈、染色體重排渣磷、基因丟失等。研...
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測序數(shù)據(jù)的深度、覆蓋度等計算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強度有多大氯葬？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
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如何對基因組序列進行注釋基因組組裝完成后挡篓，或者是完成了草圖，就不可避免遇到一個問題帚称，需要對基因組序列進行注釋官研。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
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這個軟件想在集群上跑起來還是蠻難的
macos下安裝JCVI奇葩問題。
背景 JCVI不需要介紹了,唐海寶老師開發(fā)的python環(huán)境下的比較基因組學(xué)分析可視化利器楼吃。在依賴中可以看到需要matplotlib, 這哥們好像需要LaTeX,如果不裝La...
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三代轉(zhuǎn)錄組系列：使用Cogent重建基因組編碼區(qū)盡管目前已測序的物種已經(jīng)很多了孩锡，但是對于一些動輒幾個G的復(fù)雜基因組酷宵，還沒有某個課題組有那么大的經(jīng)費去測序，所以仍舊缺少高質(zhì)量的完整基因組躬窜，那么這個時候一個高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組還是能...
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物種內(nèi)共線性圈圖繪制寡壮，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了讹弯！整天有人問况既，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義组民？你想說談什么生物學(xué)故事棒仍？ 承認吧，你什么都不知道臭胜，什么都沒搞...
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測序數(shù)據(jù)質(zhì)控和預(yù)處理之fastp
1. 引言 下機的FASTQ數(shù)據(jù)通常需要進行質(zhì)控和預(yù)處理莫其，以保證下游分析輸?shù)臏蚀_性。fastp軟件僅掃描數(shù)據(jù)文件一次耸三，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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未明學(xué)院專注于通過項目制教學(xué)來教授學(xué)員數(shù)據(jù)分析&數(shù)據(jù)挖掘技能仪壮。本著讓學(xué)習(xí)更有趣憨颠、讓學(xué)員的簡歷不再單薄的教學(xué)理念，未明學(xué)院為每一組學(xué)員設(shè)計緊跟企業(yè)界熱點的數(shù)據(jù)處理項目积锅，通過項目制學(xué)習(xí)（PBL）的方式爽彤，讓學(xué)員在掌握數(shù)據(jù)處理技能的同時，收獲一個高含金量的項目經(jīng)歷缚陷。未明學(xué)院成立一年多來适篙，已經(jīng)幫助數(shù)千位學(xué)員實現(xiàn)簡歷的蛻變，許多學(xué)員拿到了諸如中信證券箫爷、阿里巴巴等知名企業(yè)的全職offer嚷节，以及哥倫比亞大學(xué)，牛津大學(xué)等世界知名學(xué)府的研究生offer虎锚。
