又是17點(diǎn)，周日，適合休息届惋。這周周末沒(méi)回貴陽(yáng)陪家人也就只能回辦公桌摸魚。或許是我的心態(tài)有變化？當(dāng)然偎箫，這并不影響。不能做大事皆串，那就做一些小事淹办。索性把積累的一些小事逐個(gè)捋捋，一一...
IP屬地：甘肅
-
隨筆 | 如何「抹去」團(tuán)隊(duì)成員的創(chuàng)造力與激情
-
同源染色體片段檢測(cè)工具ColinearScan的使用寫在前面 更好的閱讀體驗(yàn)請(qǐng)移步這里齐遵。確定染色體同源片段是基因組學(xué)研究的一個(gè)重要方面，有助于揭示基因組在歷史上發(fā)生的多種多樣的進(jìn)化事件塔插，如DNA復(fù)制梗摇、染色體重排、基因丟失等想许。研...
-
測(cè)序數(shù)據(jù)的深度漱凝、覆蓋度等計(jì)算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大疮蹦？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)序...
-
如何對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋基因組組裝完成后，或者是完成了草圖茸炒，就不可避免遇到一個(gè)問(wèn)題愕乎，需要對(duì)基因組序列進(jìn)行注釋。注釋之前首先得構(gòu)建基因模型壁公，有三種策略： 從頭注釋(de novo prediction...
-
-
這個(gè)軟件想在集群上跑起來(lái)還是蠻難的
macos下安裝JCVI奇葩問(wèn)題紊册。
背景 JCVI不需要介紹了,唐海寶老師開發(fā)的python環(huán)境下的比較基因組學(xué)分析可視化利器比肄。在依賴中可以看到需要matplotlib, 這哥們好像需要LaTeX,如果不裝La...
-
三代轉(zhuǎn)錄組系列：使用Cogent重建基因組編碼區(qū)盡管目前已測(cè)序的物種已經(jīng)很多了芳绩，但是對(duì)于一些動(dòng)輒幾個(gè)G的復(fù)雜基因組，還沒(méi)有某個(gè)課題組有那么大的經(jīng)費(fèi)去測(cè)序撞反，所以仍舊缺少高質(zhì)量的完整基因組妥色，那么這個(gè)時(shí)候一個(gè)高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組還是能...
-
-
物種內(nèi)共線性圈圖繪制惑折，有那么難嗎授账？寫在前面 我受夠了枯跑！整天有人問(wèn)，TBtools怎么畫這個(gè)圖 但是我其實(shí)只想回一句： 你畫這個(gè)圖干什么白热？有什么意義敛助？你想說(shuō)談什么生物學(xué)故事？ 承認(rèn)吧屋确，你什么都不知道纳击，什么都沒(méi)搞...
-
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控和預(yù)處理之fastp
1. 引言 下機(jī)的FASTQ數(shù)據(jù)通常需要進(jìn)行質(zhì)控和預(yù)處理，以保證下游分析輸?shù)臏?zhǔn)確性攻臀。fastp軟件僅掃描數(shù)據(jù)文件一次焕数，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
-
未明學(xué)院專注于通過(guò)項(xiàng)目制教學(xué)來(lái)教授學(xué)員數(shù)據(jù)分析&數(shù)據(jù)挖掘技能堡赔。本著讓學(xué)習(xí)更有趣、讓學(xué)員的簡(jiǎn)歷不再單薄的教學(xué)理念设联，未明學(xué)院為每一組學(xué)員設(shè)計(jì)緊跟企業(yè)界熱點(diǎn)的數(shù)據(jù)處理項(xiàng)目善已，通過(guò)項(xiàng)目制學(xué)習(xí)（PBL）的方式，讓學(xué)員在掌握數(shù)據(jù)處理技能的同時(shí)离例，收獲一個(gè)高含金量的項(xiàng)目經(jīng)歷雕拼。未明學(xué)院成立一年多來(lái)，已經(jīng)幫助數(shù)千位學(xué)員實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)歷的蛻變粘招，許多學(xué)員拿到了諸如中信證券啥寇、阿里巴巴等知名企業(yè)的全職offer，以及哥倫比亞大學(xué)洒扎，牛津大學(xué)等世界知名學(xué)府的研究生offer辑甜。
