遇到的問(wèn)題： 生存分析進(jìn)行過(guò)程中猫胁，一直發(fā)生報(bào)錯(cuò)，代碼及 錯(cuò)誤如下： ggsurvplot(fit)Error in data.frame(..., check.names =...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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生存曲線(xiàn)繪制出現(xiàn)Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : arguments imply differing number of r... -
GDC Data Transfer Tool 下載TCGA數(shù)據(jù)一渊季、GDC Data Transfer Tool下載 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python開(kāi)發(fā)的下載程序街夭，在TCGA官網(wǎng)GDC部分可以找...
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免疫學(xué)碩士一枚～<br>生信熱愛(ài)者但是小白一枚~<br>目前成就為0~<br>加油哦捎泻，一大波成就正在路上啦~<br>啾~豬莎要加油哦~
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R語(yǔ)言 -- customLayout 包 拼圖目標(biāo) 使用R拼出這樣的一張圖： Let's start 1. 安裝 customLayout 包 簡(jiǎn)單介紹一下 customLayout 包： lay_new(mat, wi...
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生存分析（二）-- Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型（Cox proportional-hazards model）翻譯自：http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-hazards-model[http://www.sthda.c...
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腫瘤分子亞型/分型的含義及目的腫瘤分子分型(molecular classification)由美國(guó)國(guó)立癌癥研究所首次提出臀叙，通過(guò)分子分析技術(shù)為腫瘤進(jìn)行分類(lèi)，使腫瘤分類(lèi)從傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)轉(zhuǎn)向以分子特征為基礎(chǔ)的分...
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如果不滿(mǎn)懷希望，那滿(mǎn)懷什么呢慎璧！
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TCGA+biomarker——決策曲線(xiàn)分析法（DCA）
DCA曲線(xiàn)簡(jiǎn)介 DCA是一種評(píng)估臨床預(yù)測(cè)模型床嫌、診斷試驗(yàn)和分子標(biāo)記物的簡(jiǎn)單方法。傳統(tǒng)的診斷試驗(yàn)指標(biāo)如：敏感性胸私，特異性和ROC曲線(xiàn)下面積僅測(cè)量預(yù)測(cè)模型的診斷準(zhǔn)確性厌处，未能考慮特定模...
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R語(yǔ)言| 連續(xù)變量取cutoff值：基于KM曲線(xiàn)歡迎大家關(guān)注我的公眾號(hào)：一只勤奮的科研喵[http://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__biz=Mzg2MjU2NDQwMg==&hid=2&s...
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COX回歸之nomogram列線(xiàn)圖看到丫姐畫(huà)完這篇1區(qū)28分JCO里所有的圖這篇推文后阔涉，對(duì)里面出現(xiàn)的nomogram列線(xiàn)圖以及用于評(píng)價(jià)模型的圖十分眼饞，于是決定試著畫(huà)畫(huà)看 1. 使用rms包的cph()建立c...
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2020-01-08單因素COX分析和建立模型
cox_t<-cox_train[,-c(1:9)] cox_t<-log2(cox_t+0.1)###記得查看結(jié)果，是否有NAN字逗，很奇快京郑，沒(méi)項(xiàng)獨(dú)立運(yùn)輸沒(méi)有NAN，但這一句一...
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2019-12-13 小白新手筆記 GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載及ID轉(zhuǎn)換
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載 library(Biobase) library(BiocGenerics) library(parallel) library(GEOquery) ges...
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易學(xué)統(tǒng)計(jì)原創(chuàng)公眾號(hào)套腹，專(zhuān)注臨床統(tǒng)計(jì)绪抛，科研數(shù)據(jù)挖掘！
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GEO挖掘?qū)崙?zhàn)二电禀、差異分析及富集分析「生信技能樹(shù)」三陰性乳腺癌表達(dá)矩陣探索 系列筆記GEO挖掘?qū)崙?zhàn)一幢码、初步探索數(shù)據(jù) - 簡(jiǎn)書(shū)GEO挖掘?qū)崙?zhàn)二、差異分析及富集分析 - 簡(jiǎn)書(shū)GEO挖掘?qū)崙?zhàn)三尖飞、GSVA - 簡(jiǎn)書(shū)GE...
