公眾號(hào)：BioIT愛(ài)好者（ID: bioitee）<br><br>語(yǔ)雀：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.yuque.com%2Fshenweiyan" target="_blank">https://www.yuque.com/shenweiyan</a>
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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已畢業(yè)蔑穴，抱歉不搞這個(gè)了
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SNP過(guò)濾時(shí)常用參數(shù)的解析（群體遺傳）關(guān)于為何要進(jìn)行SNP的過(guò)濾： 第一十拣，低質(zhì)量和無(wú)信息的SNP會(huì)影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果封拧，甚至影響后續(xù)對(duì)生物學(xué)問(wèn)題的解釋?zhuān)坏诙后w研究時(shí)夭问，由于測(cè)序的個(gè)體較多檢測(cè)出來(lái)...
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GATK入門(mén)的最佳姿勢(shì)
GATK缰趋，全稱(chēng)是Genome Anlysis Toolkit捧杉，顧名思義陕见，是一套用于分析基因組的工具箱。主要功能是尋找變異位點(diǎn)和基因分型味抖，但是實(shí)際上功能超多评甜，導(dǎo)致初學(xué)者都不知道...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡(jiǎn)信不回答問(wèn)題忍坷，有問(wèn)題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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你好，想問(wèn)下熔脂，用GATK得到的SNPs后佩研，用什么程序再次進(jìn)行質(zhì)量篩選，得到高質(zhì)量的SNPs呢霞揉？
「簡(jiǎn)化基因組」如何過(guò)濾用GATK分析得到的SNP
GATK官方提供了一個(gè)SNP過(guò)濾的標(biāo)準(zhǔn)旬薯，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求來(lái)過(guò)濾簡(jiǎn)化基因組中的SNP數(shù)據(jù)，也就是...
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