公眾號：BioIT愛好者（ID: bioitee）<br><br>語雀：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.yuque.com%2Fshenweiyan" target="_blank">https://www.yuque.com/shenweiyan</a>
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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已畢業(yè)，抱歉不搞這個了
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SNP過濾時常用參數(shù)的解析（群體遺傳）關(guān)于為何要進(jìn)行SNP的過濾： 第一砌梆，低質(zhì)量和無信息的SNP會影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果默责，甚至影響后續(xù)對生物學(xué)問題的解釋；第二咸包，群體研究時桃序，由于測序的個體較多檢測出來...
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GATK入門的最佳姿勢
GATK媒熊，全稱是Genome Anlysis Toolkit，顧名思義坟比，是一套用于分析基因組的工具箱芦鳍。主要功能是尋找變異位點和基因分型，但是實際上功能超多葛账，導(dǎo)致初學(xué)者都不知道...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題籍琳，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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你好菲宴，想問下，用GATK得到的SNPs后趋急，用什么程序再次進(jìn)行質(zhì)量篩選裙顽，得到高質(zhì)量的SNPs呢？
「簡化基因組」如何過濾用GATK分析得到的SNP
GATK官方提供了一個SNP過濾的標(biāo)準(zhǔn)宣谈，howto-apply-hard-filters-to-a-call-set,如果你按照它的要求來過濾簡化基因組中的SNP數(shù)據(jù)愈犹，也就是...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
