IP屬地：廣東
-
-
ChromHMM：染色質(zhì)狀態(tài)發(fā)現(xiàn)和表征ChromHMM 是一個基于隱馬爾可夫模型（Hidden Markov Model, HMM）的計算工具述么，它用于系統(tǒng)地鑒定和表征基因組中的染色質(zhì)狀態(tài)籍琳。這些狀態(tài)通常與不同的基因...
-
單細胞轉錄組流程一：安裝運行cellranger及結果解讀
單細胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細胞的小伙伴對Cell Ranger這個軟件都不陌生菲宴，我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法魂贬。Cell R...
-
hisat2比對軟件將reads比對到參考基因組
轉載：https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的繼...
-
利用TrimGalore去除adapter以及過濾fastq文件學校網(wǎng)課筆記~ 今天的網(wǎng)課主要介紹怎么把原始的fastq文件根據(jù)fastqc結果進行去接頭愈犹、以及過濾掉低質(zhì)量的reads。 主講人介紹目前主要使用的去接頭/過濾的軟件有三種：...
-
MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
-
2019意猶未盡的基因組可視化IGV（一）劉小澤寫于19.6.8之前最開始學習IGV的時候?qū)戇^兩篇推文琼牧，當時簡單做了了解恢筝，但有朋友說意猶未盡，嗯我也這么覺得巨坊，總覺得還是學的不夠撬槽。推薦閱讀：https://github...
-
R包clusterProfiler: 轉換ID、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉換不用怕抱究，clusterProfiler幫你忙這篇詳細講了無參考基因組該怎么辦恢氯，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG開頭...
-
我眼中的barcodes.tsv.gz/features.tsv.gz/matrix.mtx.gz前段時間一直在用cellranger count進行單細胞測序數(shù)據(jù)的處理，不得不說Cell Ranger作為10X Genomics官方的單細胞數(shù)據(jù)處理工具鼓寺，功能還是很強大的...
-
11.芯片數(shù)據(jù)GEO數(shù)據(jù)庫下載一敢靡、基因芯片 基因芯片：由大量cDNA或寡核苷酸探針密集排列而形成的探針陣列，其基本原理是雜交測序方法苦银。 cDNA芯片制作：通過克隆的方法獲得目的cDNA序列啸胧，將其作為探針高...
