發(fā)簡信
IP屬地：黑龍江
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轉(zhuǎn)錄組丨limma差異表達分析筋遭，繪制火山圖和熱圖
limma差異表達分析 本篇筆記的內(nèi)容是在R語言中利用limma包進行差異表達分析簇秒，主要針對轉(zhuǎn)錄組測序得到的基因表達數(shù)據(jù)進行下游分析糊秆，并將分析結(jié)果可視化耘擂，繪制火山圖和熱圖 [...
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WGCNA分析 | 全流程代碼分享 | 代碼二--關(guān)于WGNCA的教程饭玲，本次的共有三期教程酸钦，我們同時做了三個分析的比較，差異性相對還是比較大的咱枉，詳情可看WGCNA分析 | 你的數(shù)據(jù)結(jié)果真的是準確的嗎？徒恋？[https://...
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WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一注意：今天的教程比較長蚕断，請規(guī)劃好你的時間。本文是付費內(nèi)容入挣，在本文文末有本教程的全部的代碼和示例數(shù)據(jù)亿乳。 輸出結(jié)果 分析代碼 關(guān)于WGCNA分析，如果你的數(shù)據(jù)量較大，建議使用服務...
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空間轉(zhuǎn)錄組分析方法追蹤作者葛假，Evil Genius 周五了障陶，又一周過去了，疫情越來越嚴重了聊训，很多城市都封控了抱究，但是呢，不影響大家看文獻带斑，做科研鼓寺，最主要的，可以在家看世界杯勋磕。 今天來一篇空間的方法文...
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從國家基因組科學數(shù)據(jù)中心（NGDC）下載原始測序數(shù)據(jù)最近在看擬南芥基因組組裝相關(guān)的論文妈候，想把論文中提到的原始測序數(shù)據(jù)下載下來，論文中數(shù)據(jù)獲取的部分寫道 The raw sequencing data for the PacBi...
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使用DESeq2進行轉(zhuǎn)錄組原始count標準化和差異分析轉(zhuǎn)錄組測序完成后挂滓，一般我們會獲得一個原始 read count表達矩陣苦银，其中行是基因，列是樣品赶站。常用的差異分析工具包括limma幔虏、edgeR和DESeq2。DESeq2在測序...
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時空通訊分析大盤點作者亲怠，Evil Genius hello所计，大家好，國慶后的第二天团秽，我們繼續(xù)盤點主胧，關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)盤點了三篇文章，放在下面习勤，供大家參考和相互交流踪栋。 10X空間轉(zhuǎn)錄組重點分析合...
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7.1 GWAS：系統(tǒng)進化樹——MEGA系統(tǒng)發(fā)育樹 系統(tǒng)發(fā)育樹是表明被認為具有共同祖先的各物種/材料之間的演化關(guān)系樹形圖，用來描述物種（或材料图毕、序列等）之間的分類和演化關(guān)系夷都，是反映群體結(jié)構(gòu)最經(jīng)典、直觀予颤、有效的方法囤官；...
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免費、好用蛤虐、強大的 Markdown 編輯器綜合評測和推薦免費党饮、好用、強大的 Markdown 編輯器綜合評測和推薦 如今驳庭，在編輯器領(lǐng)域刑顺，Markdown 大行其道氯窍。那么，如何使用 Markdown 語法呢蹲堂？又如何選擇合適的 Mar...
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【R實戰(zhàn)】批量繪制ROC曲線柒竞，復現(xiàn)figure前面給大家介紹了ROC曲線的基因概念?ROC曲線簡介[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...
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跟著Nature學作圖：R語言ggplot2箱線圖疊加蜂群圖完整示例論文 Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding https://w...
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跟著Nature Genetics學作圖：R語言ggplot2散點圖突出強調(diào)其中某些點論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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Nature子刊：高通量蛋白質(zhì)組學方法學綜述在后基因組時代政供，蛋白質(zhì)組學在生物醫(yī)學研究中發(fā)揮著重要作用。近日能犯，Nature子刊《Laboratory Investigation》發(fā)表了一篇高通量蛋白組的mini-revi...
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