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【orthofinder】在被限制進程的服務(wù)器中使用注意事項這陣子開始做比較基因組的項目，由于沒有root而且也不想折騰orthomcl饰迹，所以首選orthofinder，故而先是安裝皿淋，這次使用conda安裝 安裝完成之后或听，本來打算用r...
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單拷貝直系同源基因構(gòu)建物種進化樹最近用Orthofinder做物種進化樹，最后出來的物種樹的結(jié)構(gòu)跟已發(fā)表研究的結(jié)果差距較大渔彰，在我的印象里Orthofinder軟件是用單拷貝直系同源基因進行建樹的嵌屎，然后跟老師...
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用R語言進行相關(guān)性分析：畫出散點圖、擬合線及標(biāo)注相關(guān)系數(shù)和P值一. 讀取數(shù)據(jù) 因為我們一般自己錄的數(shù)據(jù)都是excel表格的恍涂，對于讀取excel宝惰，此處有一個小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
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鑒定tandem repeats的python腳本
鏈接https://github.com/rohansachdeva/tandem_repeats[https://github.com/rohansachdeva/tand...
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Linux中的文件內(nèi)查找小技巧寫在前面的廢話 這一周我為自己的馬虎付出了嚴(yán)重的代價！Ｔ俨住尼夺！每天十幾個小時一直在debug……以后寫代碼之前一定要拜拜雍正，專治八阿哥（bug） 雖然debug讓我無心其他事情...
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生信坑底躺著不動的男人<br>簡書不常在寝衫，有問題可私信
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正則表達式神器，以后再也不用百度了當(dāng)有項目需求用到正則表達式拐邪，你會怎么做慰毅？打開百度直接搜索「手機號正則表達式」，復(fù)制到 IDE 運行一下看一看符不符合自己的期望扎阶？ 是不是常常因為找不到合適的表達式汹胃，深惡痛絕。...
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使用R語言對SSR數(shù)據(jù)做主成分分析（PCA）的一個簡單小例子昨天的推文介紹了使用R語言對比對后的DNA序列做主成分分析的一個簡單小例子，推文下有朋友留言問如何對0,1矩陣做主成分分析（PCA）查了一下參考資料找到了一個辦法 參考資料的...
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大家好流部，我叫楊俊偉戚绕，現(xiàn)就讀于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)，在讀博士枝冀，主要從事生物信息學(xué)方面工作舞丛。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
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對群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析球切，如系統(tǒng)發(fā)育研究，PCA（主成分分析）绒障、群體結(jié)構(gòu)分析吨凑、親緣關(guān)系、基因流等進行介紹户辱，旨在搭建一個群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺鸵钝。
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群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡單明了，我這里就不再贅述庐镐，大家移步去搞清楚基本知識恩商。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
