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發(fā)簡信
IP屬地：山東
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【orthofinder】在被限制進(jìn)程的服務(wù)器中使用注意事項這陣子開始做比較基因組的項目籽御，由于沒有root而且也不想折騰orthomcl走敌，所以首選orthofinder夷野，故而先是安裝征堪，這次使用conda安裝 安裝完成之后管毙，本來打算用r...
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單拷貝直系同源基因構(gòu)建物種進(jìn)化樹最近用Orthofinder做物種進(jìn)化樹嚎莉，最后出來的物種樹的結(jié)構(gòu)跟已發(fā)表研究的結(jié)果差距較大米酬，在我的印象里Orthofinder軟件是用單拷貝直系同源基因進(jìn)行建樹的，然后跟老師...
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用R語言進(jìn)行相關(guān)性分析：畫出散點圖趋箩、擬合線及標(biāo)注相關(guān)系數(shù)和P值一. 讀取數(shù)據(jù) 因為我們一般自己錄的數(shù)據(jù)都是excel表格的赃额，對于讀取excel，此處有一個小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
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鑒定tandem repeats的python腳本
鏈接https://github.com/rohansachdeva/tandem_repeats[https://github.com/rohansachdeva/tand...
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Linux中的文件內(nèi)查找小技巧寫在前面的廢話 這一周我為自己的馬虎付出了嚴(yán)重的代價＝腥贰Ｌ肌！每天十幾個小時一直在debug……以后寫代碼之前一定要拜拜雍正竹勉，專治八阿哥（bug） 雖然debug讓我無心其他事情...
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生信坑底躺著不動的男人<br>簡書不常在次乓，有問題可私信
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正則表達(dá)式神器吓歇，以后再也不用百度了當(dāng)有項目需求用到正則表達(dá)式，你會怎么做票腰？打開百度直接搜索「手機(jī)號正則表達(dá)式」城看，復(fù)制到 IDE 運(yùn)行一下看一看符不符合自己的期望？ 是不是常常因為找不到合適的表達(dá)式丧慈，深惡痛絕析命。...
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使用R語言對SSR數(shù)據(jù)做主成分分析（PCA）的一個簡單小例子昨天的推文介紹了使用R語言對比對后的DNA序列做主成分分析的一個簡單小例子鹃愤，推文下有朋友留言問如何對0,1矩陣做主成分分析（PCA）查了一下參考資料找到了一個辦法 參考資料的...
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大家好姿现，我叫楊俊偉，現(xiàn)就讀于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)肖抱，在讀博士备典，主要從事生物信息學(xué)方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
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對群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析，如系統(tǒng)發(fā)育研究荤崇，PCA（主成分分析）拌屏、群體結(jié)構(gòu)分析、親緣關(guān)系术荤、基因流等進(jìn)行介紹倚喂，旨在搭建一個群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺。
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群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡單明了瓣戚，我這里就不再贅述端圈，大家移步去搞清楚基本知識。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
