240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    Read count铁材、CPM愧薛、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別

    1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到栅盲。一般而言,隨著測(cè)序深度的增加哩牍,基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...

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    xCellx詳細(xì)使用方法及結(jié)果分析

    理論知識(shí): 組織是由不同譜系和亞型的細(xì)胞類型組成的復(fù)雜環(huán)境错忱,每種細(xì)胞都有自己獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄組。因此侯繁,批量轉(zhuǎn)錄組分析是細(xì)胞類型特異性基因表達(dá)的總和加權(quán)的細(xì)胞類型比例在給定的樣本胖喳。去...

  • GEO數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)總結(jié)(一)數(shù)據(jù)下載

    非常感謝jimmy大神與生信技能樹(shù)一直以來(lái)的無(wú)私分享,自己學(xué)習(xí)的同時(shí)也伴隨著記錄贮竟,如有錯(cuò)誤的丽焊,歡迎大家指正~~~~ 1.數(shù)據(jù)下載 Ⅰ、R代碼直接下載數(shù)據(jù) 建議以Rdata形式...

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    用R語(yǔ)言調(diào)整表格列的順序

    R語(yǔ)言里的數(shù)據(jù)框雌贱,約等于表格。比表格多一個(gè)要求就是一列只允許一種數(shù)據(jù)類型的存在偿短。 需求 將數(shù)據(jù)框最后一列放到第一列的位置,形如: 方法一.base包的方法 如果數(shù)據(jù)框有80列...

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