啟動(dòng)子 啟動(dòng)子是RNA 聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列倘待，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動(dòng)子本身不被...
IP屬地：湖南
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PlantCARE預(yù)測(cè)植物啟動(dòng)子-順式作用元件 -
中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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大佬是煙草研究所的啊羨慕??
JBrowse會(huì)顯示紅色Error框處理
前言：先宣傳一波我們自己開(kāi)發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)盖腕，歡迎大家多提意見(jiàn)赫冬，多引用。 自從我們第一個(gè)版本發(fā)布之后（Jin et al, 2013 Bioinformatics）溃列，就獲得了大量的訪...
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【比較基因組學(xué)】基因家族擴(kuò)張與收縮分析前言：因?yàn)樽罱戧懤m(xù)續(xù)接手了幾個(gè)物種的基因組項(xiàng)目面殖，這也是生信分析中很大的一塊。其中最基礎(chǔ)的是組裝和注釋（當(dāng)然我們實(shí)驗(yàn)室也做組裝方法學(xué)的研究）】蘖現(xiàn)在隨著很多物種基因組的發(fā)表脊僚，純...
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PLncDB V2.0: 植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA數(shù)據(jù)庫(kù)今天寫寫我們自己做的數(shù)據(jù)庫(kù)，歡迎大家提意見(jiàn)，多引用辽幌。 長(zhǎng)鏈非編碼RNA是一類廣泛存在增淹、長(zhǎng)度大于200 個(gè)堿基的非編碼調(diào)控分子。它深度參與植物生長(zhǎng)發(fā)育乌企、逆境脅迫與次生代謝等諸多...
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GO捌归，KEGG，DO富集分析這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻（GO岭粤，KEGG惜索，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的剃浇，自行忽略.... 市面上公...
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您好巾兆，我看到您寫到非模式生物用AnnotationHub這個(gè)包，在這里面您舉得例子是番茄偿渡，您寫到“解決完標(biāo)準(zhǔn)注釋庫(kù)的問(wèn)題，剩下的和模式生物做富集分析完全一樣了”霸奕，番茄的geneid是solycXxxx這種形式的溜宽，這種形式并不是symbolid，請(qǐng)問(wèn)如何solycxxxx形式的id轉(zhuǎn)變?yōu)镋NTREZID呢质帅？
GO适揉，KEGG，DO富集分析
這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻（GO煤惩，KEGG嫉嘀，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的魄揉，自行忽略.... 市面上公...
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你好剪侮，你下載的Sl3.0里面有g(shù)ene nane一列嗎
非模式生物如何做富集分析
最近在分析數(shù)據(jù)水稻的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，遇到了一系列問(wèn)題，感覺(jué)是之前沒(méi)有踏踏實(shí)實(shí)學(xué)習(xí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析而留下的隱患全部爆雷了瓣俯。也挺好杰标！這樣才能知道不足。這次是水稻的富集分析彩匕，參考網(wǎng)上的資...
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致力于成為生信全棧工程師
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轉(zhuǎn)錄組入門（8）：差異基因結(jié)果注釋作業(yè)要求 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集驼仪，對(duì)這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析掸犬。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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生物信息編程
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聯(lián)合使用deeptools和自編R腳本分析鏈特異性數(shù)據(jù)不積跬步無(wú)以至千里 deeptools作為分析深度測(cè)序數(shù)據(jù)的一大利器改览，受到了廣泛的歡迎和關(guān)注，這一點(diǎn)從Github的星標(biāo)數(shù)以及conda的安裝次數(shù)就可以知道缤言，很多人都對(duì)它非常...
