啟動(dòng)子 啟動(dòng)子是RNA 聚合酶識(shí)別钢猛、結(jié)合和開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列伙菜，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動(dòng)子本身不被...
IP屬地：西藏
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PlantCARE預(yù)測(cè)植物啟動(dòng)子-順式作用元件 -
【比較基因組學(xué)】基因家族擴(kuò)張與收縮分析前言：因?yàn)樽罱戧懤m(xù)續(xù)接手了幾個(gè)物種的基因組項(xiàng)目命迈，這也是生信分析中很大的一塊贩绕。其中最基礎(chǔ)的是組裝和注釋?zhuān)ó?dāng)然我們實(shí)驗(yàn)室也做組裝方法學(xué)的研究）。現(xiàn)在隨著很多物種基因組的發(fā)表壶愤，純...
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PLncDB V2.0: 植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA數(shù)據(jù)庫(kù)今天寫(xiě)寫(xiě)我們自己做的數(shù)據(jù)庫(kù)淑倾，歡迎大家提意見(jiàn)，多引用征椒。 長(zhǎng)鏈非編碼RNA是一類(lèi)廣泛存在娇哆、長(zhǎng)度大于200 個(gè)堿基的非編碼調(diào)控分子。它深度參與植物生長(zhǎng)發(fā)育、逆境脅迫與次生代謝等諸多...
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GO碍讨，KEGG治力，DO富集分析這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻（GO，KEGG垄开，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解琴许，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的，自行忽略.... 市面上公...
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轉(zhuǎn)錄組入門(mén)（8）：差異基因結(jié)果注釋作業(yè)要求 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集溉躲，對(duì)這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析榜田。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分...
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滿(mǎn)滿(mǎn)的一天
開(kāi)工 特別充足，早上醒來(lái)特別早锻梳，整理苗箭券，洗瓶瓶罐罐，種番茄疑枯，依舊平淡辩块，實(shí)驗(yàn)的生活，默默地又開(kāi)始荆永。 感動(dòng) 人多還是不錯(cuò)废亭，好像難得被感動(dòng)到，隔離了外界的環(huán)境一般具钥，完全沒(méi)有意識(shí)到恐...
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聯(lián)合使用deeptools和自編R腳本分析鏈特異性數(shù)據(jù)不積跬步無(wú)以至千里 deeptools作為分析深度測(cè)序數(shù)據(jù)的一大利器豆村，受到了廣泛的歡迎和關(guān)注，這一點(diǎn)從Github的星標(biāo)數(shù)以及conda的安裝次數(shù)就可以知道骂删，很多人都對(duì)它非常...
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APAtrap的使用網(wǎng)站：https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 說(shuō)明書(shū)：https://sourceforge.net/p/apatrap/wiki...
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Linux對(duì)文件名進(jìn)行操作——截取
在shell中進(jìn)行文件操作時(shí)掌动，我們很多時(shí)候想對(duì)文件名進(jìn)行截取，例如去掉文件名的后綴宁玫，而只保留剩余的部分粗恢。下面介紹使用 ${} 來(lái)完成上述任務(wù)。 示例任務(wù) 我們想對(duì) share...
