比對軟件很多,首先大家去收集一下班挖,因為我們是帶大家入門树酪,請統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
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關于ATAC-seq分析,在網(wǎng)上看到兩篇關于同一片綜述的翻譯解虱,寫的很好:ATAC-seq數(shù)據(jù)分析工具的比較和推薦(Genome Biology綜述)ATAC-seq生信分析綜...
寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了映挂,相關腳本泽篮、教程也很多,但我還是自己系統(tǒng)的總結一下吧柑船。有時候感覺是浪費時間帽撑,但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學習到很多新的知識,不斷記錄反思鞍时,也...
ATAC-seq全稱Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing笙僚,即利...
轉自:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=635619&do=blog&id=884213 用tophat和cu...
前一段時間跟著孟浩巍大神的視頻學習讥电,在自己的小破筆記本上還是跑完了整個RNAseq差異表達的分析流程( tophat2 + cufflink + cuffdiff )雖然這個...
一蹂窖、探針的標記 如下設置探針標記的反應體系: (1)待標記探針 (1.75 pmol/μl) :2μl (2)T4 Polynucleotide Kinase Buffer ...
環(huán)境-> 虛擬機: oracle vm virtualbox 虛擬系統(tǒng): centOS7 本地系統(tǒng): win7 工具: secureCRT 說明-> 有時需要將本地...