比對(duì)軟件很多转唉，首先大家去收集一下急凰，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T睛约，請(qǐng)統(tǒng)一用hisat2(官網(wǎng)https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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RNA-seq(5):序列比對(duì)：Hisat2 -
使用HINT-ATAC進(jìn)行ATAC-Seq的footprinting分析關(guān)于ATAC-seq分析，在網(wǎng)上看到兩篇關(guān)于同一片綜述的翻譯迹栓，寫的很好：ATAC-seq數(shù)據(jù)分析工具的比較和推薦（Genome Biology綜述）ATAC-seq生信分析綜...
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我要偷偷內(nèi)卷藕夫，然后驚艷所有人！
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級(jí)分析+多組學(xué)分析寫在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了枯冈，相關(guān)腳本毅贮、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧尘奏。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間滩褥，但是在寫的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí)，不斷記錄反思炫加，也...
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科研小白，努力搞科研酒甸，發(fā)文章中探熔。這個(gè)平臺(tái)算是我的學(xué)習(xí)筆記吧！
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ATAC-seq入門ATAC-seq全稱Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing烘挫，即利...
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用tophat和cufflinks分析RNAseq數(shù)據(jù)(2018-05-28)
轉(zhuǎn)自：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=635619&do=blog&id=884213 用tophat和cu...
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完整轉(zhuǎn)錄組RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）前一段時(shí)間跟著孟浩巍大神的視頻學(xué)習(xí)，在自己的小破筆記本上還是跑完了整個(gè)RNAseq差異表達(dá)的分析流程（ tophat2 + cufflink + cuffdiff ）雖然這個(gè)...
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EMSA實(shí)驗(yàn)步驟
一豌鹤、探針的標(biāo)記 如下設(shè)置探針標(biāo)記的反應(yīng)體系： （1）待標(biāo)記探針 (1.75 pmol/μl) ：2μl （2）T4 Polynucleotide Kinase Buffer ...
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本地電腦上傳文件到虛擬機(jī)
環(huán)境-> 虛擬機(jī): oracle vm virtualbox 虛擬系統(tǒng): centOS7 本地系統(tǒng): win7 工具: secureCRT 說(shuō)明-> 有時(shí)需要將本地...
