更新20181216 今天又把KaKs_calculator2.0的幫助手冊翻出來看了一遍惰赋,找到了一句話:Before calculation, gaps and stop ...
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主要從如何看圖礁苗、用圖與作圖三個方面來對箱線圖進行理解和總結。 1、看圖 如圖所示,箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進行繪制的呻惕,包含6個數(shù)據(jù)節(jié)點,分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣滥比、上...
morris William Morris palettes for ggplot2 分享一個ggplot2中的藝術調色板亚脆,各位看官老爺細細品味,喜歡請關注個人公眾號R語言數(shù)...
簡介 文章較長盲泛,點擊直達我的博客濒持,瀏覽效果更好。本文內容基本是來源于STHDA寺滚,這是一份十分詳細的ggplot2使用指南柑营,因此我將其翻譯成中文,一是有助于我自己學習理解村视,另外...
今天要模仿的圖片來自于論文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...
基因序列中的密碼子隨著時間的推移以幾乎恒定的比例進行替換官套,具有恒定的演化速率,因此兩個物種時間的遺傳距離與物種分歧時間成正比。 本文就利用mcmctree估算物種分歧時間做一...
PCA分析與解釋 PCA是一種無參數(shù)的數(shù)據(jù)降維方法虏杰,常用的機器學習算法一種,這篇文章主要從PCA應用于解釋兩個方面介紹勒虾。關于PCA原理纺阔,詳情這里[https://royals...
PCA(Principal Component Analysis)主成分分析, 用來考察多個變量間相關性一種多元統(tǒng)計方法修然,研究如何通過少數(shù)幾個主成分來揭示多個變量間的內部結構...
Beast是用來進行貝葉斯MCMC分析的一系列合集軟件笛钝,其主要組成程序有BEAUti、BEAST愕宋、Tracer玻靡、TreeAnnotator、FigTree中贝,這幾個軟件的組...
分析流程 1.上傳四個樣本原始就文件到服務器 參考http://www.reibang.com/p/a84cd44bac67[http://www.reibang.com...
系統(tǒng)發(fā)育樹是研究物種進化歷史必不可少的信息囤捻,我們可以利用它得到一些重要歷史線索,如: 生物多樣性(物種形成或滅絕)邻寿; 物種性狀進化與多樣化(Character evoluti...
我覺得處理任何事情蝎土,不僅要做到“知其然”,還要做到“知其所以然”绣否。在做事情時誊涯,如果僅知道低頭蠻干,不知道抬頭看路蒜撮;只知道跟著“牽牛繩”的方向暴构,在鞭子的抽打下前進或停止,那么最...
Nathan寫于2020.08.15群體的地理分布,是做文章經(jīng)常放的第一張圖沐序,其表明你的群體材料在地理上分布的情況(感覺是一句廢話) 01 input 首先輸入數(shù)據(jù)是樣品分組...
使用BWA+samtools+gatk4.0進行SNP calling 首先下載數(shù)據(jù)eg: 01.align 首先定義相關用到的變量晶丘,然后使用baw創(chuàng)建索引之后進行map。 ...
1.使用GCTA對群體進行PCA分析 相關結果數(shù)據(jù)見上篇簡書 2.使用admixture進行群體的structure分析