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更新20181216 今天又把KaKs_calculator2.0的幫助手冊(cè)翻出來看了一遍肃弟，找到了一句話：Before calculation, gaps and stop ...

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主要從如何看圖、用圖與作圖三個(gè)方面來對(duì)箱線圖進(jìn)行理解和總結(jié)希太。 1、看圖 如圖所示，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進(jìn)行繪制的肺素，包含6個(gè)數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣宇驾、上...

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morris William Morris palettes for ggplot2 分享一個(gè)ggplot2中的藝術(shù)調(diào)色板倍靡，各位看官老爺細(xì)細(xì)品味，喜歡請(qǐng)關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)R語言數(shù)...

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簡(jiǎn)介 文章較長(zhǎng)课舍，點(diǎn)擊直達(dá)我的博客塌西，瀏覽效果更好。本文內(nèi)容基本是來源于STHDA筝尾，這是一份十分詳細(xì)的ggplot2使用指南捡需，因此我將其翻譯成中文，一是有助于我自己學(xué)習(xí)理解筹淫，另外...

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今天要模仿的圖片來自于論文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...

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基因序列中的密碼子隨著時(shí)間的推移以幾乎恒定的比例進(jìn)行替換站辉，具有恒定的演化速率，因此兩個(gè)物種時(shí)間的遺傳距離與物種分歧時(shí)間成正比。 本文就利用mcmctree估算物種分歧時(shí)間做一...

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PCA分析與解釋 PCA是一種無參數(shù)的數(shù)據(jù)降維方法饰剥，常用的機(jī)器學(xué)習(xí)算法一種殊霞，這篇文章主要從PCA應(yīng)用于解釋兩個(gè)方面介紹。關(guān)于PCA原理捐川，詳情這里[https://royals...

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PCA（Principal Component Analysis）主成分分析脓鹃， 用來考察多個(gè)變量間相關(guān)性一種多元統(tǒng)計(jì)方法，研究如何通過少數(shù)幾個(gè)主成分來揭示多個(gè)變量間的內(nèi)部結(jié)構(gòu)...

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分析流程 1.上傳四個(gè)樣本原始就文件到服務(wù)器 參考http://www.reibang.com/p/a84cd44bac67[http://www.reibang.com...

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系統(tǒng)發(fā)育樹是研究物種進(jìn)化歷史必不可少的信息盹沈，我們可以利用它得到一些重要?dú)v史線索龄章，如： 生物多樣性（物種形成或滅絕）； 物種性狀進(jìn)化與多樣化（Character evoluti...

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我覺得處理任何事情乞封，不僅要做到“知其然”做裙，還要做到“知其所以然”。在做事情時(shí)肃晚，如果僅知道低頭蠻干锚贱，不知道抬頭看路；只知道跟著“牽牛繩”的方向关串，在鞭子的抽打下前進(jìn)或停止拧廊，那么最...

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共線性：物種間的共線性是由于物種間產(chǎn)生分歧，從同一祖先繼承來的遺傳信息經(jīng)過各自的進(jìn)化后晋修，仍保留了大量的高度相似序列吧碾。分析：通過基因/基因組序列基于同源基因?qū)﹁b定共線性區(qū)塊（M...

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Nathan寫于2020.08.15群體的地理分布倦春，是做文章經(jīng)常放的第一張圖，其表明你的群體材料在地理上分布的情況（感覺是一句廢話） 01 input 首先輸入數(shù)據(jù)是樣品分組...