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一文講完葉綠體基因組比較分析的全部軟件和配套ggplot繪圖腳本前段時間柄沮，發(fā)表了一篇葉綠體基因組比較分析文章祭务。盡管這類套路文已經不再熱門平绩，但在準備數(shù)據(jù)分析的過程中臼勉，仍感各種資料教程之零散，各種文章的做圖工具也是令人眼花繚亂惊豺。故此燎孟，列出個人...
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多序列比對,進化樹分析,motif預測,密碼子偏好性分析(2)多序列比對,進化樹分析,motif預測,密碼子偏好性分析(1)進行BopA蛋白序列下載，多序列比對及進化樹分析后尸昧，這部分進行保守性和密碼子偏好性分析揩页。背景：自噬是細胞的一種重...
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4?? 核酸序列特征分析(6):密碼子使用模式的分析[序列比對和序列特征分析總目錄](http://www.reibang.com/p/878f2b2495ae 一共20種編碼氨基酸，除去3個終止密碼子烹俗，一共61個密碼子爆侣。也...
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RNA-seq：由sra到fastq~首先兔仰，在文獻中找到了GSE號，在右上角中的GEO accession中輸入蕉鸳，來到了這一個頁面 1. 下載表達矩陣 拉到最後乎赴，下載GSExxxxxx_RAW.tar 2. 下載...
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使用clusterProfiler進行GO、KEGG富集分析（有參情況）尋找差異表達的基因并識別它們的功能潮尝，是我們進行RNA測序的最主要目的榕吼。很明顯，這些差異的基因必然與功能改變密切相關勉失，例如羹蚣，比較患病個體與正常個體的組織表達譜，不難想到這些顯著...
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基于TBtools做基因家族分析教程 （全）一乱凿、 寫在前面 2023年4月中旬自己開始做基因家族的分析顽素，對于這塊自己沒有接觸過，因此也是一個挑戰(zhàn)徒蟆，沒事Ｐ渤觥！６紊蟆（安慰自己）全蝶，對于基因家族的分析網上的教程很多，跟著步驟走就可...
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如何使用「TBtools」進行基因差異表達分析戚哎？寫在前面 今天休息了一天裸诽，大體學了一下一直有想法學，但是沒時間學的東西型凳。結果就是丈冬，太難了。時間有限甘畅，還是放下埂蕊。但今天還剩下三個多小時往弓，總得做點啥⌒钛酰看看函似，似乎今天沒寫啥推文。于...
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文獻閱讀--MLOs基因在生殖中的作用今天精讀的文獻是2月13日發(fā)表在《Nature Plants》上的《Integration of ovular signals and exocytosis of a Ca2...
