總結(jié)（看的有限）： 1. 大部分方法為基于深度（劃分區(qū)間檢測(cè)）的方法（FPKM、區(qū)域堿基數(shù)的類(lèi)似FPKM算法）迹鹅。 2.大部分軟件會(huì)使用對(duì)照樣本作為reference作為基線卦洽，...
今天分享一個(gè)接純生信又接收SEER數(shù)據(jù)挖掘的期刊，這個(gè)期刊就是Bosnian Journal of Basic Medical Sciences弟蚀，簡(jiǎn)稱(chēng)BJBMS蚤霞，影響因子：2...
雜志概要 今天要介紹的期刊是cancer immunology research，創(chuàng)刊于2013年断医，同Clinical Cancer Research、Cancer Rese...
SEER數(shù)據(jù)的大規(guī)模數(shù)據(jù)優(yōu)勢(shì)是無(wú)可比擬的。大規(guī)模的病例數(shù)還可以減輕病理學(xué)診斷的少數(shù)或隨機(jī)錯(cuò)誤分類(lèi)的影響序调。SEER依靠實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)量規(guī)范來(lái)最大程度地減少此類(lèi)錯(cuò)誤 腫瘤發(fā)病率的研究...
SEER數(shù)據(jù)庫(kù)介紹 基本介紹：SEER數(shù)據(jù)庫(kù)全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results )醉锅，是美國(guó)權(quán)威的癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)庫(kù)，該數(shù)...
四種方法发绢，可以新增數(shù)據(jù)列 直接賦值 df.apply方法 df.assign方法 按條件選擇分組分別賦值 1硬耍、直接賦值 注意，df["bWendu"]其實(shí)是一個(gè)Series,...
通過(guò)Pandas庫(kù)可以從多種格式的數(shù)據(jù)文件中讀取數(shù)據(jù)边酒，也可以將處理后的數(shù)據(jù)寫(xiě)入到這些文件中经柴。pandas庫(kù)中的pd.read_excel()相較之前的xlrd庫(kù)的讀表操作更加...
在上一篇文章《GEO數(shù)據(jù)挖掘：（一）尋找共同差異基因》中我們通過(guò)兩個(gè)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)尋找到了一些差異基因，本篇文章將對(duì)這些差異基因的互作關(guān)系進(jìn)行簡(jiǎn)單的分析墩朦，用到的工具主要有Stri...
前言 通常，在識(shí)別完了差異基因之后牛哺，都會(huì)對(duì)差異基因進(jìn)行功能富集陋气，來(lái)獲取差異基因參與的潛在生物學(xué)功能通路或生物學(xué)進(jìn)程，有助于理解基因之間的作用關(guān)系以及發(fā)現(xiàn)基因在癌癥發(fā)生發(fā)展過(guò)程...
拿到一串感興趣的基因引润，它們究竟參與那些生物學(xué)功能巩趁，是否與預(yù)期相符？最簡(jiǎn)單的解釋辦法是通路富集分析（pathway enrichment anlysis）淳附。通路富集分析的基本步...
