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總結(jié)(看的有限): 1. 大部分方法為基于深度(劃分區(qū)間檢測)的方法(FPKM碑诉、區(qū)域堿基數(shù)的類似FPKM算法)。 2.大部分軟件會使用對照樣本作為reference作為基線侥锦,...
今天分享一個接純生信又接收SEER數(shù)據(jù)挖掘的期刊快毛,這個期刊就是Bosnian Journal of Basic Medical Sciences,簡稱BJBMS番挺,影響因子:2...
雜志概要 今天要介紹的期刊是cancer immunology research襟衰,創(chuàng)刊于2013年,同Clinical Cancer Research粪摘、Cancer Rese...
SEER數(shù)據(jù)的大規(guī)模數(shù)據(jù)優(yōu)勢是無可比擬的徘意。大規(guī)模的病例數(shù)還可以減輕病理學診斷的少數(shù)或隨機錯誤分類的影響瑰妄。SEER依靠實驗室的質(zhì)量規(guī)范來最大程度地減少此類錯誤 腫瘤發(fā)病率的研究...
SEER數(shù)據(jù)庫介紹 基本介紹:SEER數(shù)據(jù)庫全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results ),是美國權(quán)威的癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)庫映砖,該數(shù)...
四種方法间坐,可以新增數(shù)據(jù)列 直接賦值 df.apply方法 df.assign方法 按條件選擇分組分別賦值 1、直接賦值 注意邑退,df["bWendu"]其實是一個Series,...
通過Pandas庫可以從多種格式的數(shù)據(jù)文件中讀取數(shù)據(jù)竹宋,也可以將處理后的數(shù)據(jù)寫入到這些文件中。pandas庫中的pd.read_excel()相較之前的xlrd庫的讀表操作更加...
在上一篇文章《GEO數(shù)據(jù)挖掘:(一)尋找共同差異基因》中我們通過兩個實驗的數(shù)據(jù)尋找到了一些差異基因地技,本篇文章將對這些差異基因的互作關系進行簡單的分析蜈七,用到的工具主要有Stri...
前言 通常飒硅,在識別完了差異基因之后,都會對差異基因進行功能富集作谚,來獲取差異基因參與的潛在生物學功能通路或生物學進程三娩,有助于理解基因之間的作用關系以及發(fā)現(xiàn)基因在癌癥發(fā)生發(fā)展過程...
拿到一串感興趣的基因,它們究竟參與那些生物學功能妹懒,是否與預期相符雀监?最簡單的解釋辦法是通路富集分析(pathway enrichment anlysis)。通路富集分析的基本步...