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總結(看的有限): 1. 大部分方法為基于深度(劃分區(qū)間檢測)的方法(FPKM、區(qū)域堿基數的類似FPKM算法)贱除。 2.大部分軟件會使用對照樣本作為reference作為基線生闲,...
今天分享一個接純生信又接收SEER數據挖掘的期刊,這個期刊就是Bosnian Journal of Basic Medical Sciences扯躺,簡稱BJBMS捉兴,影響因子:2...
雜志概要 今天要介紹的期刊是cancer immunology research,創(chuàng)刊于2013年澎埠,同Clinical Cancer Research虽缕、Cancer Rese...
SEER數據的大規(guī)模數據優(yōu)勢是無可比擬的氮趋。大規(guī)模的病例數還可以減輕病理學診斷的少數或隨機錯誤分類的影響。SEER依靠實驗室的質量規(guī)范來最大程度地減少此類錯誤 腫瘤發(fā)病率的研究...
SEER數據庫介紹 基本介紹:SEER數據庫全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results )江耀,是美國權威的癌癥統(tǒng)計數據庫剩胁,該數...
四種方法,可以新增數據列 直接賦值 df.apply方法 df.assign方法 按條件選擇分組分別賦值 1祥国、直接賦值 注意摧冀,df["bWendu"]其實是一個Series,...
通過Pandas庫可以從多種格式的數據文件中讀取數據,也可以將處理后的數據寫入到這些文件中系宫。pandas庫中的pd.read_excel()相較之前的xlrd庫的讀表操作更加...
在上一篇文章《GEO數據挖掘:(一)尋找共同差異基因》中我們通過兩個實驗的數據尋找到了一些差異基因,本篇文章將對這些差異基因的互作關系進行簡單的分析建车,用到的工具主要有Stri...
前言 通常缤至,在識別完了差異基因之后潮罪,都會對差異基因進行功能富集康谆,來獲取差異基因參與的潛在生物學功能通路或生物學進程,有助于理解基因之間的作用關系以及發(fā)現基因在癌癥發(fā)生發(fā)展過程...
拿到一串感興趣的基因嫉到,它們究竟參與那些生物學功能沃暗,是否與預期相符?最簡單的解釋辦法是通路富集分析(pathway enrichment anlysis)何恶。通路富集分析的基本步...