GSEA縮寫 GSEA的全稱是Gene Set Enrichment Analysis慌闭，中文翻譯就是基因集富集分析箕别，最早提出GSEA的文章是下面的這篇文獻： 基因集富集分析是...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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通過Linux命令行使用Aspera全速上傳測序數(shù)據(jù)到NCBI數(shù)據(jù)庫每試錯一次彭雾，就離本質(zhì)就更近一步碟刺。----小藍哥 為什么要上傳數(shù)據(jù) 師姐找我?guī)兔ι蟼骱昊蚪M數(shù)據(jù)到NCBI，大概是45G薯酝。NCBI提供了很多種可供選擇的上傳方式： 沒有海外節(jié)點...
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生物信息學之 anconda / miniconda
之前在構(gòu)建生物信息學環(huán)境里面已經(jīng)介紹了這個區(qū)別半沽，也可以參考這個知乎鏈接https://zhuanlan.zhihu.com/p/35711429爽柒，下面講的是一些常用命令。 安...
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GO者填，KEGG浩村，DO 富集分析
what is Gene Ontology(GO) 基因“本體論” 對事物的分類描述，對基因的分類描述對基因的描述 1占哟、cellular component,CC(基因存在于...
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生物信息學需要掌握的 Linux 基礎(chǔ)操作符號 / : 根目錄 （寫入絕對路徑）~ : 自己的home目錄. : 當前目錄.. : 上一層目錄 （寫入相對路徑） 查看命令 ls -l (ll) : 查看詳細文件ls ...
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RNAseq基礎(chǔ)（項目設(shè)計心墅，方法原理）一、項目設(shè)計 測多少數(shù)據(jù)量榨乎？ 幾個生物學重復(fù)怎燥？ 混池測序是否性價比很高？ 參考序列怎么選蜜暑？ 二铐姚、分析方法 轉(zhuǎn)錄本拼接 比對的兩種模式 表達定量 FPKM，RPKM肛捍，TPM隐绵，T...
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GWAS 總體流程理解版
自己找了一些文章和視頻，先總結(jié)了一部分篇梭，后面再做補充和實操 一. 相關(guān)概念理解 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”氢橙，使用統(tǒng)計模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點，用于分子標記選擇...
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「三代組裝」Pacbio組裝后如何用自身數(shù)據(jù)進行polish（更新版）
之前那我由于需要對PacBio的組裝結(jié)果進行polish恬偷，于是寫了「三代組裝」Pacbio組裝后如何用自身數(shù)據(jù)進行polish悍手。最近發(fā)現(xiàn)自己又有了需求，于是重新回顧了我之前寫...
