在前面我們學(xué)習(xí)了一種有監(jiān)督的降維方法——線性判別分析（Linear Dscriminant Analysis剑刑，LDA）檐蚜。LDA不僅是一種數(shù)據(jù)壓縮方法還是一種分類算法脂信，LDA將...
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主成分分析（PCA） -
主成分分析-PCA圖的優(yōu)化（R語言）
R語言的主成分分析（PCA）詳解和帶聚類的PCA圖繪制 最近有個老師在整理文章數(shù)據(jù)振诬，由于分組較多椭员，想展示PCA圖露乏，說明不同分組的差異碧浊，公司默認(rèn)給出的PCA圖比較樸素，想做的好...
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ROH瘟仿、近交系數(shù)箱锐、親緣系數(shù)、IBD劳较、IBS連續(xù)純合片段（runs of homozygosity, ROH）是親代將同源相同的單倍型傳遞給子代而形成的驹止，基于ROH計算的基因組近交系數(shù)是個體真實的近交系數(shù)浩聋，它比傳統(tǒng)系譜...
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「Sanger Sequencing Check」系列插件支持MacOS了~寫在前面 Emmm，寒期寫了幾個插件： Primer Check臊恋，用于本地基于序列庫衣洁，檢測引物特異性 Sanger Sequencing Chek，用于查看測序峰圖抖仅，.ab1...
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GWAS生物學(xué)相關(guān)名詞解釋
背景基因 與所研究的表現(xiàn)型直接有關(guān)的基因以外的全部基因的總稱 LD : 當(dāng)位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機分布的兩個等位基因同...
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生信小工具：Plink之下載安裝與其基本格式（1）
談起Plink相信熟悉的人更定都會知道坊夫，這是一個全面的基因組分析工具集，具有很多的小功能撤卢，在SNP數(shù)據(jù)統(tǒng)計环凿，過濾，GWAS分析中都可以用得上放吩，而且速度非常的快拷邢，堪稱是生物信息...
