在前面我們學(xué)習(xí)了一種有監(jiān)督的降維方法——線性判別分析（Linear Dscriminant Analysis恕刘，LDA）张遭。LDA不僅是一種數(shù)據(jù)壓縮方法還是一種分類算法庆杜，LDA將...
IP屬地：四川
-
主成分分析（PCA） -
主成分分析-PCA圖的優(yōu)化（R語言）
R語言的主成分分析（PCA）詳解和帶聚類的PCA圖繪制 最近有個(gè)老師在整理文章數(shù)據(jù)蕴忆，由于分組較多仗岖，想展示PCA圖金麸，說明不同分組的差異擎析，公司默認(rèn)給出的PCA圖比較樸素，想做的好...
-
ROH挥下、近交系數(shù)揍魂、親緣系數(shù)桨醋、IBD、IBS連續(xù)純合片段（runs of homozygosity, ROH）是親代將同源相同的單倍型傳遞給子代而形成的现斋，基于ROH計(jì)算的基因組近交系數(shù)是個(gè)體真實(shí)的近交系數(shù)喜最，它比傳統(tǒng)系譜...
-
「Sanger Sequencing Check」系列插件支持MacOS了~寫在前面 Emmm，寒期寫了幾個(gè)插件： Primer Check步责，用于本地基于序列庫返顺，檢測引物特異性 Sanger Sequencing Chek，用于查看測序峰圖蔓肯，.ab1...
-
GWAS生物學(xué)相關(guān)名詞解釋
背景基因 與所研究的表現(xiàn)型直接有關(guān)的基因以外的全部基因的總稱 LD : 當(dāng)位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時(shí)出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機(jī)分布的兩個(gè)等位基因同...
-
生信小工具：Plink之下載安裝與其基本格式（1）
談起Plink相信熟悉的人更定都會(huì)知道遂鹊，這是一個(gè)全面的基因組分析工具集，具有很多的小功能蔗包，在SNP數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)秉扑，過濾，GWAS分析中都可以用得上调限，而且速度非常的快舟陆，堪稱是生物信息...
